83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2134 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  100 
 
 
158 aa  317  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  52 
 
 
154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  51.3 
 
 
154 aa  170  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  40.76 
 
 
156 aa  120  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  37.01 
 
 
154 aa  110  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  42.28 
 
 
152 aa  94  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  31.79 
 
 
160 aa  85.5  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  33.77 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  33.54 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  34.65 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  34.35 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  32.17 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  33.12 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  30.43 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  33.57 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1063  CheC domain protein  32.03 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  33.33 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  27.7 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  33.59 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  34.43 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  29.93 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  29.61 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  30.08 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  30.4 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  28.08 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  31.25 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  33.33 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  31.09 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  29.22 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  31.25 
 
 
154 aa  61.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  30.47 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  30.47 
 
 
154 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  30.47 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  30.47 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  30.47 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  29.69 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  29.69 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  29.69 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  28.68 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  29.69 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  26.9 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  26.77 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  26.77 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  26.77 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  26.56 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  25.69 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  25.16 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  27.66 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.07 
 
 
381 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  28.77 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  28.91 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  27.34 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  29.37 
 
 
168 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1606  hypothetical protein  25.17 
 
 
287 aa  52  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000014118  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2232  CheC domain protein  31.71 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.82 
 
 
357 aa  50.8  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  27.34 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  27.73 
 
 
168 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  32.56 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.81 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  30.3 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.78 
 
 
205 aa  48.5  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.96 
 
 
169 aa  48.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  28.57 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.71 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  25.2 
 
 
171 aa  47.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1476  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  35.9 
 
 
94 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  28.07 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  31.31 
 
 
158 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.09 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  22.96 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  23.36 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  26.67 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  22.68 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1618  hypothetical protein  21.83 
 
 
287 aa  44.3  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  32.94 
 
 
346 aa  44.3  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.72 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.72 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.76 
 
 
346 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  26.44 
 
 
169 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  22.58 
 
 
300 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  35 
 
 
370 aa  40.8  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.35 
 
 
398 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>