68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1493 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  100 
 
 
154 aa  313  7e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  50.31 
 
 
161 aa  142  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  39.07 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1063  CheC domain protein  39.07 
 
 
155 aa  113  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  37.01 
 
 
158 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  34.42 
 
 
154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  34.42 
 
 
154 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  28.57 
 
 
160 aa  97.1  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  31.58 
 
 
152 aa  92  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  35.1 
 
 
156 aa  92  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  33.33 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  32.24 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  26.8 
 
 
154 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  29.68 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  26.28 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  31.25 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  31.25 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  27.52 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  27.92 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  26.62 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  25.97 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  28.39 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  25.97 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  25.97 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  25.97 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  28.77 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  26.28 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  24.34 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  24.03 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2406  hypothetical protein  26.35 
 
 
170 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  24.03 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  24.03 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  24.18 
 
 
154 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  25.97 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  25.55 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  24.52 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  24.03 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  25.81 
 
 
164 aa  57.4  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  26.97 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  25.6 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  24.82 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  22.92 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  27.21 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  28.74 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  26.27 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  24 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  24.11 
 
 
171 aa  54.7  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  25.66 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  25.66 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  26.85 
 
 
154 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  24.84 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2232  CheC domain protein  28.37 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1476  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  31.58 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  31.2 
 
 
148 aa  48.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  23.42 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  25.89 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.32 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0308  hypothetical protein  31.09 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000030204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  27.93 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  32.32 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.32 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  30 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.08 
 
 
204 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.08 
 
 
204 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 
205 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  29.76 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  24.32 
 
 
300 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  25.78 
 
 
217 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>