20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2232 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2232  CheC domain protein  100 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  31.47 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  42.39 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  46.43 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  29.37 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  33.04 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  30.65 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  44.05 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  28.37 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  44.05 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  34.65 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  31.71 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2406  hypothetical protein  25.22 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  20.78 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1476  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  30.53 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  25.76 
 
 
300 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  29.46 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  24.81 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  24.32 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  25.87 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>