14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1476 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1476  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  100 
 
 		 94 aa  186  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  46.24 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  35.82 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  31.58 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  35.82 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  35.9 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  41.54 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  30.86 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  33.77 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2232  CheC domain protein  30.53 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  36.36 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1063  CheC domain protein  29.55 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  32.47 
 
 		 154 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  37.31 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>