15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0388 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0388  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  302  8.000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  0.837689 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0387  CheC-like family protein  43.28 
 
 		 149 aa  120  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3272  hypothetical protein  29.25 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.265581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1692  hypothetical protein  27.89 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  26.95 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  26.97 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  29.51 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  26.39 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  40.79 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04470  hypothetical protein  35.94 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  26.49 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  30.09 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.61 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  27.72 
 
 		 300 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  35.92 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>