27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3596 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3596  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  298  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5000  hypothetical protein  35 
 
 		 183 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2318  hypothetical protein  36.15 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  32.41 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  33.04 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  31.48 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.73 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  26.92 
 
 		 168 aa  50.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30880  hypothetical protein  35.05 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1786  hypothetical protein  36 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12078  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  32.04 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0324  hypothetical protein  32.48 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.496823 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  30.56 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  27.42 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1999  hypothetical protein  27.22 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1530  hypothetical protein  28.68 
 
 		 172 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.63 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  30.77 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  29.36 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  32.29 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.85 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3372  inhibitor of MCP methylation-like protein  36.36 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  31.3 
 
 		 158 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  36.11 
 
 		 184 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0888  inhibitor of MCP methylation-like protein  35.35 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0522691  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  28.97 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>