29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2318 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2318  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  321  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5000  hypothetical protein  44.04 
 
 		 183 aa  87.8  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1786  hypothetical protein  37.33 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12078  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1530  hypothetical protein  35.57 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0324  hypothetical protein  36.42 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.496823 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1999  hypothetical protein  38.19 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30880  hypothetical protein  36.71 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3596  hypothetical protein  36.15 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  42.25 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  39.53 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  31.3 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2009  inhibitor of MCP methylation-like protein  30.77 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  36.8 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1692  hypothetical protein  31.63 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  33.04 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  39.51 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  37.66 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  37.66 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3272  hypothetical protein  30.14 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.265581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  29.46 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  30.43 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3372  inhibitor of MCP methylation-like protein  25.27 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  35.79 
 
 		 168 aa  44.3  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  29.21 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  34.62 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  36 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  27.97 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  35.9 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0888  inhibitor of MCP methylation-like protein  24.18 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0522691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>