27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0888 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0888  inhibitor of MCP methylation-like protein  100 
 
 		 166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0522691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3372  inhibitor of MCP methylation-like protein  98.19 
 
 		 166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2009  inhibitor of MCP methylation-like protein  69.28 
 
 		 165 aa  247  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  62.05 
 
 		 163 aa  233  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2059  hypothetical protein  67.92 
 
 		 159 aa  221  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  28.03 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  36.26 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.06 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  29.3 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.17 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  24.85 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  27.78 
 
 		 169 aa  47.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  30.53 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  25.68 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  35.96 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  28.46 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  27.43 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  27.67 
 
 		 172 aa  43.9  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  32.91 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  34.62 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  24.2 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  30.7 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  24.38 
 
 		 168 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2318  hypothetical protein  24.18 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3596  hypothetical protein  35.35 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  22.22 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  23.58 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>