18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5000 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5000  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  354  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2318  hypothetical protein  44.04 
 
 		 161 aa  87.8  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30880  hypothetical protein  41.89 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3596  hypothetical protein  35 
 
 		 150 aa  72  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1786  hypothetical protein  37.78 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12078  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1999  hypothetical protein  36.24 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0324  hypothetical protein  32.87 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.496823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1530  hypothetical protein  32.71 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  29.59 
 
 		 155 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  32.14 
 
 		 166 aa  48.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  29.01 
 
 		 152 aa  47.8  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  29.27 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  26.76 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  25.29 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  37.33 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  36.36 
 
 		 168 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  36.51 
 
 		 166 aa  41.2  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>