13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30880 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30880  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  308  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1999  hypothetical protein  61.39 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5000  hypothetical protein  41.89 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1786  hypothetical protein  36 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12078  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2318  hypothetical protein  36.71 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0324  hypothetical protein  33.03 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.496823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3596  hypothetical protein  35.05 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1530  hypothetical protein  28.12 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  36.56 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  33.61 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  30.83 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.93 
 
 		 166 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>