214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2031 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2031  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  100 
 
 
375 aa  725    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3266  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  51.11 
 
 
372 aa  325  7e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1512  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  50.56 
 
 
365 aa  322  8e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3961  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  49.18 
 
 
367 aa  315  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1871  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  50.95 
 
 
374 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.343017  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2739  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  48.75 
 
 
367 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5840  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  51.34 
 
 
375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123688  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1612  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  51.35 
 
 
370 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2844  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  48.48 
 
 
365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801447  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0508  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  53.11 
 
 
367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.767279  normal  0.0101089 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0728  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  55.52 
 
 
358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2759  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  48.38 
 
 
375 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0985376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3172  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  47.85 
 
 
377 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2453  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  48.19 
 
 
367 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2988  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  48.39 
 
 
375 aa  295  8e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0021  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  49.34 
 
 
407 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.715843  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4473  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  50.67 
 
 
373 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3131  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  48.77 
 
 
371 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2997  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  46.8 
 
 
379 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1793  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  50.68 
 
 
395 aa  292  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187196  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1472  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  45.26 
 
 
382 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0207251  normal  0.0378204 
 
 
-
 
NC_004310  BR0927  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  45.36 
 
 
373 aa  290  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.282074  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3214  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  47.58 
 
 
377 aa  289  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.153031 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1309  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  50.27 
 
 
368 aa  289  7e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365995  normal  0.571343 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0922  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  45.5 
 
 
370 aa  288  9e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.89395  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2047  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  46.01 
 
 
529 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830123  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2331  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  48.47 
 
 
366 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2866  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  46.05 
 
 
377 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.658726  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1667  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  46.2 
 
 
366 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8387  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0928  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  49.72 
 
 
371 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.681846 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1905  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  45.45 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.957383  hitchhiker  0.00957237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2112  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  44.63 
 
 
372 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0924  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  46.56 
 
 
375 aa  266  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.922761 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3809  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  45.6 
 
 
378 aa  260  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6056  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  50.28 
 
 
371 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0173505  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1156  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  50 
 
 
371 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2150  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  45.38 
 
 
359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1912  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  48.09 
 
 
369 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2582  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  45.71 
 
 
374 aa  246  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0848  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.67 
 
 
369 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.134258  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1168  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.4 
 
 
369 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.51487  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02937  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  42.98 
 
 
362 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0574  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.33 
 
 
367 aa  206  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3145  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.12 
 
 
369 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00139586  normal  0.961785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1245  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.12 
 
 
369 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141519  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0993  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.95 
 
 
369 aa  205  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0555  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.06 
 
 
366 aa  203  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10527  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1212  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.74 
 
 
369 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0351  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  32.77 
 
 
354 aa  202  8e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2407  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  41.64 
 
 
380 aa  202  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00172923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1126  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.11 
 
 
369 aa  202  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0114032  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0123  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  39.15 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00432099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0140  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  39.15 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00515473  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0695  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  37.53 
 
 
366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0263664  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3051  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  41.73 
 
 
371 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0557287  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2964  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.57 
 
 
369 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00763014  normal  0.0108139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3060  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.29 
 
 
369 aa  199  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00819971  hitchhiker  0.00206136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0298  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  40.5 
 
 
378 aa  199  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.590599  normal  0.0104222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0464  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  39.78 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0239521  normal  0.200849 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2882  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.29 
 
 
369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018792  hitchhiker  0.000000284725 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3351  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.13 
 
 
376 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00607668  hitchhiker  0.0000468917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3929  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.29 
 
 
363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00335468  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0222  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.87 
 
 
370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1313  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.25 
 
 
369 aa  196  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0606  hypothetical protein  38.33 
 
 
356 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0171782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1724  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.27 
 
 
370 aa  195  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0808287  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4725  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.32 
 
 
396 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0948433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4567  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.61 
 
 
364 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198658  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46010  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.46 
 
 
364 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0610  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.4 
 
 
376 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314922  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2973  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.6 
 
 
370 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.128782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1808  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  38.38 
 
 
374 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422838  hitchhiker  0.00114252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1210  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  36.29 
 
 
369 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0359226  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2812  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  34.78 
 
 
370 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.122574  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1354  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  33.7 
 
 
366 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0467  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  39.51 
 
 
363 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00711264  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004408  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  34.33 
 
 
370 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00990  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  34.33 
 
 
375 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1358  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  33.43 
 
 
366 aa  190  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0474  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  41.51 
 
 
375 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.649133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1102  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  34.77 
 
 
369 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.068241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4769  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  40.38 
 
 
356 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000191936  normal  0.81961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0434  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  39.12 
 
 
363 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1020  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.41 
 
 
369 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.01577  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2058  protein of unknown function UPF0075  40 
 
 
400 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2557  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.95 
 
 
384 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0368994  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0457  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  39.35 
 
 
372 aa  187  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0143622  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1878  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.95 
 
 
370 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1770  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.95 
 
 
370 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0871268  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0334  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  33.78 
 
 
373 aa  186  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.881064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2000  protein of unknown function UPF0075  35.97 
 
 
369 aa  186  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000246481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2352  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.77 
 
 
369 aa  186  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0170825  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01610  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.97 
 
 
369 aa  186  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1989  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.97 
 
 
369 aa  186  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1832  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.97 
 
 
369 aa  186  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.474183  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01600  hypothetical protein  35.97 
 
 
369 aa  186  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1716  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.97 
 
 
369 aa  186  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.213735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1559  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.97 
 
 
369 aa  185  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5100  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  35.08 
 
 
363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122958  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0909  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  34.6 
 
 
376 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>