184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1030 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
295 aa  610  1e-173  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  55.93 
 
 
295 aa  353  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  53.71 
 
 
298 aa  318  6e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0708  Radical SAM domain protein  47.44 
 
 
306 aa  276  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  43 
 
 
290 aa  249  4e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  46.13 
 
 
275 aa  243  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.14 
 
 
298 aa  237  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0183  radical SAM domain-containing protein  39.42 
 
 
289 aa  205  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  28.9 
 
 
386 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  29.22 
 
 
393 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  29.55 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  29.21 
 
 
387 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  28.52 
 
 
386 aa  132  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
437 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  29.58 
 
 
395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  34.36 
 
 
281 aa  126  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  27.84 
 
 
377 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 
375 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  39.18 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 
380 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3317  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 
355 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.355052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  27.82 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 
385 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  35.07 
 
 
294 aa  119  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  29.67 
 
 
361 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  31.32 
 
 
372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  26.3 
 
 
384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  31.21 
 
 
385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  29.89 
 
 
390 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  34.48 
 
 
297 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  29.89 
 
 
390 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 
390 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 
352 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0055  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 
355 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  31.2 
 
 
362 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  35.08 
 
 
362 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  25.47 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  28.22 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  28.17 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  28.69 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  32.94 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  31.28 
 
 
391 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  35.57 
 
 
276 aa  113  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  27.55 
 
 
325 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  30.45 
 
 
392 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  30.86 
 
 
388 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 
387 aa  112  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  30.86 
 
 
392 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  30.86 
 
 
392 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  25.82 
 
 
350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  29.6 
 
 
353 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  29.12 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  28.04 
 
 
417 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 
385 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 
385 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 
385 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  29.84 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 
370 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 
392 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  34.76 
 
 
294 aa  109  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 
389 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3708  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 
354 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000832138  hitchhiker  0.000000507033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00810  putative DNA repair photolyase  29.97 
 
 
352 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 
385 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 
374 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  28.11 
 
 
373 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 
373 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  33.96 
 
 
352 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  29.51 
 
 
374 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  29.02 
 
 
352 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 
376 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 
392 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  33.68 
 
 
366 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 
385 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12598  hypothetical protein  28.12 
 
 
340 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 
352 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  28.42 
 
 
381 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 
338 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  30.56 
 
 
352 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  25.43 
 
 
360 aa  106  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 
352 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  32.02 
 
 
288 aa  105  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 
381 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1900  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 
303 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 
258 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2296  radical SAM family protein  28.16 
 
 
341 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2343  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 
341 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2335  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 
358 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799816  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  33.51 
 
 
390 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  28.94 
 
 
352 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
374 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>