191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1003 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  776    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  92.91 
 
 
381 aa  722    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  80.16 
 
 
386 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  77.78 
 
 
388 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  76.98 
 
 
391 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  77.78 
 
 
392 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  77.78 
 
 
392 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  77 
 
 
392 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  76.74 
 
 
392 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  76.74 
 
 
392 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  75.79 
 
 
385 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  75.79 
 
 
385 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  79.49 
 
 
385 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  74.87 
 
 
376 aa  567  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  79.2 
 
 
385 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  79.49 
 
 
385 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  78.63 
 
 
383 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  79.48 
 
 
374 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  65.84 
 
 
417 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  67.9 
 
 
415 aa  498  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  66.57 
 
 
375 aa  472  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  62.16 
 
 
374 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  61.73 
 
 
374 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  60.99 
 
 
366 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  62.32 
 
 
364 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  55.34 
 
 
363 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  58.03 
 
 
365 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  55.05 
 
 
385 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  57.22 
 
 
402 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  57.94 
 
 
389 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  52.99 
 
 
372 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  53.59 
 
 
386 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  52.49 
 
 
387 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  56.53 
 
 
372 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  51.3 
 
 
356 aa  385  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  52.76 
 
 
386 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  52.69 
 
 
395 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  52.49 
 
 
386 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  54.1 
 
 
385 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  56.2 
 
 
437 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  52.21 
 
 
393 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  54.07 
 
 
352 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  53.03 
 
 
352 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  51.25 
 
 
375 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  52.74 
 
 
352 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  52.74 
 
 
352 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  56.53 
 
 
385 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  53.2 
 
 
353 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  53.85 
 
 
361 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  51.43 
 
 
421 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  53.89 
 
 
352 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  53.03 
 
 
352 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  52.11 
 
 
387 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  53.19 
 
 
360 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  54.52 
 
 
384 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2190  radical SAM domain-containing protein  54.22 
 
 
373 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32306  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  53.47 
 
 
390 aa  364  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  53.47 
 
 
390 aa  364  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  52.4 
 
 
361 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  53.46 
 
 
360 aa  362  8e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  50.98 
 
 
377 aa  362  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  55.29 
 
 
385 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  52.85 
 
 
390 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  53.71 
 
 
385 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  55.92 
 
 
362 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  51.6 
 
 
373 aa  359  5e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  51.84 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  52.75 
 
 
362 aa  355  5.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  52.16 
 
 
352 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  50.13 
 
 
368 aa  354  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00810  putative DNA repair photolyase  53.89 
 
 
352 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  55.32 
 
 
362 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  55.32 
 
 
362 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  53.33 
 
 
374 aa  351  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  54.85 
 
 
359 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  53.03 
 
 
380 aa  348  8e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  51.32 
 
 
360 aa  341  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  54.33 
 
 
375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  47.83 
 
 
387 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  51.2 
 
 
362 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  50 
 
 
358 aa  333  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  50.59 
 
 
362 aa  333  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  48.62 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1181  radical SAM family protein  53.43 
 
 
362 aa  324  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204222  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3675  radical SAM domain-containing protein  52.69 
 
 
371 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.852388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  53.21 
 
 
372 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2212  hypothetical protein  50.95 
 
 
325 aa  315  7e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  45.99 
 
 
352 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5416  radical SAM domain-containing protein  52.63 
 
 
378 aa  296  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  46.59 
 
 
359 aa  292  6e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  41.81 
 
 
350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  50.49 
 
 
355 aa  286  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1071  Radical SAM domain protein  44.09 
 
 
360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  46.17 
 
 
357 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  45.17 
 
 
352 aa  273  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  38.77 
 
 
356 aa  268  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  39.81 
 
 
354 aa  263  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  45.18 
 
 
343 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  45.48 
 
 
343 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  39.94 
 
 
357 aa  256  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>