186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2292 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  100 
 
 
298 aa  612  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  55.99 
 
 
295 aa  348  9e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  53.71 
 
 
295 aa  318  6e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0708  Radical SAM domain protein  44.37 
 
 
306 aa  260  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  48.19 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  44.49 
 
 
298 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  41.67 
 
 
290 aa  233  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0183  radical SAM domain-containing protein  42.8 
 
 
289 aa  209  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  31.45 
 
 
361 aa  158  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  32.84 
 
 
325 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  37.31 
 
 
281 aa  134  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  32.44 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 
388 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  31.93 
 
 
374 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  29.01 
 
 
392 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 
392 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  34.39 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  29.47 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  33.84 
 
 
352 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 
392 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 
392 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  40.21 
 
 
258 aa  126  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 
362 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  30.5 
 
 
381 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  32.77 
 
 
377 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 
421 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  34.03 
 
 
437 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  28.33 
 
 
391 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  34.34 
 
 
356 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  32.54 
 
 
386 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 
395 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1900  Radical SAM domain protein  32.91 
 
 
303 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  32.54 
 
 
386 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  31.09 
 
 
374 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  29.34 
 
 
350 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 
392 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  26.96 
 
 
376 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  34.03 
 
 
393 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
383 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
385 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  33.83 
 
 
261 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  31.98 
 
 
390 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
385 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
385 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
385 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
385 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  25 
 
 
360 aa  122  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  27.12 
 
 
368 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 
362 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  30.7 
 
 
390 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  30.7 
 
 
390 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
389 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  33.65 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  30.7 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 
374 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  32.49 
 
 
375 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 
362 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  29.8 
 
 
375 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  30.23 
 
 
384 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 
353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  35.45 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 
370 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  27.74 
 
 
356 aa  119  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  33.33 
 
 
352 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  31.58 
 
 
387 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  33.33 
 
 
386 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  31.86 
 
 
350 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 
385 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  29.5 
 
 
387 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 
363 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 
372 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  26.91 
 
 
365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  28.63 
 
 
380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  29.26 
 
 
364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  32.98 
 
 
352 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  34.03 
 
 
269 aa  116  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  28.63 
 
 
374 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  33.5 
 
 
385 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  31.98 
 
 
385 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 
352 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 
362 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  35.63 
 
 
294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  31.51 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  31.98 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  29.95 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  30.37 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  31.1 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  27.52 
 
 
415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  28.42 
 
 
378 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  26.17 
 
 
350 aa  112  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  34.67 
 
 
267 aa  113  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  29.72 
 
 
281 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 
372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>