191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0117 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  92.33 
 
 		 352 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 352 aa  726    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  92.61 
 
 		 352 aa  678    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  91.48 
 
 		 352 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  82.67 
 
 		 352 aa  600  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  78.69 
 
 		 352 aa  591  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  77.84 
 
 		 352 aa  584  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00810  putative DNA repair photolyase  75 
 
 		 352 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  70.25 
 
 		 353 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  65.71 
 
 		 358 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  57.39 
 
 		 372 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  57.51 
 
 		 363 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  53.67 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  57.1 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  55.2 
 
 		 381 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  55.81 
 
 		 375 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  53.74 
 
 		 385 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  54.96 
 
 		 380 aa  381  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  53.74 
 
 		 385 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  53.78 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  54.96 
 
 		 374 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  53.47 
 
 		 374 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  54.05 
 
 		 385 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  53.01 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  53.76 
 
 		 385 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  54.07 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  54.05 
 
 		 385 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  54 
 
 		 374 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  54.07 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  57.22 
 
 		 390 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  54 
 
 		 374 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  56.03 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  53.71 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  51.61 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  52.69 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  53.2 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  52.46 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  56.37 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  52.91 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  53.14 
 
 		 385 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  52.62 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  52.46 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  52.46 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  55.12 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  55.69 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  51.45 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  55.46 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  54.67 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  54.42 
 
 		 360 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  53.98 
 
 		 368 aa  364  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  55.36 
 
 		 385 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  54.81 
 
 		 385 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  54.57 
 
 		 384 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  54.99 
 
 		 437 aa  363  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  58.52 
 
 		 359 aa  361  9e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  51.27 
 
 		 390 aa  361  9e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2212  hypothetical protein  56 
 
 		 325 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  50.99 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  53.22 
 
 		 365 aa  359  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  50.99 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  54.71 
 
 		 361 aa  359  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  55.75 
 
 		 361 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  50.43 
 
 		 386 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  51 
 
 		 387 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  52.72 
 
 		 387 aa  354  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  52.92 
 
 		 366 aa  355  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  53.52 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  51.4 
 
 		 415 aa  353  4e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  50.58 
 
 		 377 aa  352  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  50.71 
 
 		 386 aa  352  7e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  49.86 
 
 		 393 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  49.29 
 
 		 386 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  56.82 
 
 		 389 aa  349  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  50.73 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  55.87 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  57.31 
 
 		 372 aa  345  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  54.95 
 
 		 378 aa  345  8e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2190  radical SAM domain-containing protein  52.57 
 
 		 373 aa  345  8.999999999999999e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  55.01 
 
 		 362 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  51.23 
 
 		 372 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  53.58 
 
 		 362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  49.01 
 
 		 362 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  50.14 
 
 		 373 aa  335  9e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3675  radical SAM domain-containing protein  52.42 
 
 		 371 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.852388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  48.77 
 
 		 385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  48.77 
 
 		 402 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5416  radical SAM domain-containing protein  57.18 
 
 		 378 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1181  radical SAM family protein  51.27 
 
 		 362 aa  315  6e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  45.53 
 
 		 350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  52.62 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  46.05 
 
 		 352 aa  302  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  46 
 
 		 352 aa  299  5e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  47.88 
 
 		 357 aa  299  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1071  Radical SAM domain protein  44.29 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  42.65 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  42.3 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0140  radical SAM domain-containing protein  72.82 
 
 		 206 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.899788  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  41.26 
 
 		 357 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  45.76 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  43.27 
 
 		 343 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>