186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1488 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  100 
 
 
368 aa  744    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  80.95 
 
 
373 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  58.29 
 
 
362 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  59.4 
 
 
357 aa  403  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2004  Radical SAM domain protein  61.74 
 
 
368 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  63.17 
 
 
350 aa  393  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  59.37 
 
 
338 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1808  Radical SAM domain protein  59.43 
 
 
345 aa  371  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0645523  normal  0.369217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1952  Radical SAM domain protein  55.45 
 
 
344 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12598  hypothetical protein  56.64 
 
 
340 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2296  radical SAM family protein  58.81 
 
 
341 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2343  radical SAM domain-containing protein  58.81 
 
 
341 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2335  radical SAM domain-containing protein  58.81 
 
 
358 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799816  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1745  Radical SAM domain protein  57.59 
 
 
342 aa  355  7.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3795  radical SAM domain-containing protein  58.33 
 
 
339 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18338  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  52.8 
 
 
349 aa  351  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  57.59 
 
 
370 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1220  radical SAM domain-containing protein  54.95 
 
 
329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0539702  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  50.79 
 
 
338 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0729  radical SAM domain-containing protein  54.04 
 
 
345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  50.47 
 
 
389 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2697  Hedgehog/intein hint domain protein  52.54 
 
 
715 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4479  DNA repair photolyase-like protein  40.57 
 
 
320 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1761  radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 
360 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3251  Radical SAM domain protein  49.35 
 
 
698 aa  215  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  38.73 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  38.91 
 
 
363 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  36.69 
 
 
352 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  38.87 
 
 
352 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  38.26 
 
 
421 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  38.8 
 
 
352 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1900  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 
303 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  34.01 
 
 
374 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  35.08 
 
 
352 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  38.67 
 
 
385 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  38.67 
 
 
385 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  38.67 
 
 
385 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  38.67 
 
 
385 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  38.67 
 
 
383 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  38.67 
 
 
385 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  38.8 
 
 
352 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  38.4 
 
 
352 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  37.89 
 
 
376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  38.28 
 
 
374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  37.55 
 
 
372 aa  182  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  38.37 
 
 
386 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  38.72 
 
 
360 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  39.59 
 
 
387 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 
302 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  36.91 
 
 
374 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  36.82 
 
 
392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  36.82 
 
 
392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  37.21 
 
 
392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  36.82 
 
 
388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  38.78 
 
 
386 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  41.18 
 
 
360 aa  179  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  37.82 
 
 
352 aa  179  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  32.86 
 
 
290 aa  179  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  37.96 
 
 
393 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 
362 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  37.31 
 
 
391 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  38.03 
 
 
395 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 
362 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  36.7 
 
 
381 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  33.21 
 
 
356 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  40.14 
 
 
362 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  36.54 
 
 
392 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  34.47 
 
 
375 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  37.55 
 
 
387 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  37.9 
 
 
417 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  36.54 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  35.58 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  37.7 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  38.68 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  35.74 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  39.57 
 
 
385 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  37.92 
 
 
375 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  31.97 
 
 
325 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  39.91 
 
 
385 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 
385 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  36.78 
 
 
362 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  37.3 
 
 
360 aa  170  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 
390 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  36.73 
 
 
377 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  37.39 
 
 
384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  33.95 
 
 
366 aa  165  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  35.22 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  35.27 
 
 
415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  32.41 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  36.92 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  34.96 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  35.22 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  37.76 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  36.43 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  35.25 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  42.36 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  35.91 
 
 
362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  42.36 
 
 
343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  35.54 
 
 
385 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  35.74 
 
 
361 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>