190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1782 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
281 aa  566  1e-160  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  55.35 
 
 
258 aa  246  3e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  45.56 
 
 
258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  46.33 
 
 
276 aa  237  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  49.41 
 
 
269 aa  230  2e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  48.22 
 
 
267 aa  226  4e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  45.06 
 
 
288 aa  218  1e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1163  radical SAM domain-containing protein  44.27 
 
 
269 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000309895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  46.41 
 
 
261 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  38.02 
 
 
256 aa  159  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  43.02 
 
 
182 aa  155  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  37.93 
 
 
281 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  37.55 
 
 
350 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  42.02 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  39.65 
 
 
301 aa  142  8e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  40.09 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  38.7 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  37.33 
 
 
245 aa  139  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  42.61 
 
 
294 aa  138  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  40.51 
 
 
384 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  37.31 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  39.88 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  41.05 
 
 
437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 
395 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  38.97 
 
 
390 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  37.82 
 
 
386 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  38.97 
 
 
390 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  37.82 
 
 
387 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  37.82 
 
 
393 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  38.34 
 
 
377 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 
390 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0830  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0807  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  37.31 
 
 
386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  37.7 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  36.32 
 
 
374 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  36.32 
 
 
380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  38.07 
 
 
352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  37.37 
 
 
385 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  34.36 
 
 
295 aa  126  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  32 
 
 
295 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  40.1 
 
 
375 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 
352 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  38.53 
 
 
352 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  38.53 
 
 
352 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  37.44 
 
 
421 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  38.98 
 
 
385 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  38.66 
 
 
385 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  37.14 
 
 
368 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  38.98 
 
 
385 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  37.95 
 
 
386 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  37.44 
 
 
387 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  33.82 
 
 
361 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  37.37 
 
 
362 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  39.73 
 
 
362 aa  123  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  39.43 
 
 
360 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  34.95 
 
 
363 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  36.14 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  36.98 
 
 
352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  42.35 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  35.96 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  36.02 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1314  Radical SAM domain protein  38.61 
 
 
311 aa  119  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.263305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  39.89 
 
 
359 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1952  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 
344 aa  119  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2906  radical SAM family protein  35.88 
 
 
306 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 
275 aa  119  7e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  42.11 
 
 
372 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  35.41 
 
 
386 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  35.07 
 
 
362 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  35.27 
 
 
391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  38.03 
 
 
366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  37.85 
 
 
360 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  35.89 
 
 
374 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  35.89 
 
 
392 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 
388 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  34.78 
 
 
392 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 
392 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  32.41 
 
 
356 aa  116  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.85 
 
 
298 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  41.48 
 
 
387 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  35.89 
 
 
381 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  36.23 
 
 
375 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  35.27 
 
 
376 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0708  Radical SAM domain protein  38.21 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2299  radical SAM domain-containing protein  36.71 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.002919  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  31.73 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  39.06 
 
 
361 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 
385 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 
385 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 
383 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 
385 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1721  radical SAM domain-containing protein  35.08 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  34.05 
 
 
300 aa  112  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  38.5 
 
 
362 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>