194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0196 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
297 aa  604  9.999999999999999e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  76.53 
 
 
298 aa  463  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  75.42 
 
 
301 aa  463  1e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  78.77 
 
 
294 aa  441  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  53.66 
 
 
301 aa  292  4e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  44.76 
 
 
294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  45.07 
 
 
300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  45.27 
 
 
267 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  47.37 
 
 
288 aa  151  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  39.64 
 
 
281 aa  146  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  45.27 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  32.88 
 
 
350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  46.01 
 
 
258 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  44.83 
 
 
258 aa  129  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3317  radical SAM domain-containing protein  40.3 
 
 
355 aa  125  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.355052 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1163  radical SAM domain-containing protein  47.37 
 
 
269 aa  124  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000309895 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  35.52 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  38.14 
 
 
389 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  28.15 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  36.21 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  37.78 
 
 
391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  37.23 
 
 
392 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  37.84 
 
 
362 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  33.33 
 
 
357 aa  116  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  37.23 
 
 
381 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  36.8 
 
 
392 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  36.8 
 
 
392 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  36 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  36.8 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  42.11 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  39.41 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  36.73 
 
 
392 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3708  Radical SAM domain protein  38.05 
 
 
354 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000832138  hitchhiker  0.000000507033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  38.07 
 
 
374 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  36.44 
 
 
392 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  41.79 
 
 
352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0055  radical SAM domain-containing protein  38.31 
 
 
355 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  41.29 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  41.36 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  41.36 
 
 
380 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  36.8 
 
 
376 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  39.34 
 
 
357 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  40.82 
 
 
366 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  34.78 
 
 
417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  35.58 
 
 
361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  36.27 
 
 
375 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  39.25 
 
 
359 aa  109  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  26.64 
 
 
298 aa  108  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  36.8 
 
 
385 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  36.8 
 
 
383 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  36.8 
 
 
385 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  40.46 
 
 
375 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  36.8 
 
 
385 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 
372 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  41.29 
 
 
352 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  39.57 
 
 
415 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  34.76 
 
 
295 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  36.8 
 
 
385 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  36.8 
 
 
385 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  41.29 
 
 
352 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.1 
 
 
298 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  36.7 
 
 
261 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  31.23 
 
 
385 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  37.3 
 
 
368 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  37.5 
 
 
360 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  35.57 
 
 
393 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  35.66 
 
 
359 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  39.44 
 
 
362 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2299  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 
309 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.002919  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 
374 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  37.06 
 
 
374 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  35.94 
 
 
390 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  38.89 
 
 
362 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
389 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  35.68 
 
 
294 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  38.24 
 
 
352 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  37.75 
 
 
352 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  36.96 
 
 
352 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  35.9 
 
 
386 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  38.55 
 
 
364 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2479  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
368 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  39.49 
 
 
361 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  37.43 
 
 
395 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  35.79 
 
 
390 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  38.64 
 
 
362 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  38.95 
 
 
353 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  35.79 
 
 
390 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  31.46 
 
 
368 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  34.36 
 
 
386 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  37.89 
 
 
182 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  34.36 
 
 
387 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  38.1 
 
 
358 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  35.14 
 
 
352 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  36.79 
 
 
384 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 
387 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  35.94 
 
 
421 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  31.96 
 
 
356 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  35.6 
 
 
363 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>