200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1769 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 352 aa  732    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  47.01 
 
 		 357 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  45.85 
 
 		 354 aa  319  5e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  48.14 
 
 		 359 aa  317  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  46.31 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  49.16 
 
 		 363 aa  315  8e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1071  Radical SAM domain protein  45.71 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  47.29 
 
 		 357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  48.24 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  49.68 
 
 		 377 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  46 
 
 		 352 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  46.65 
 
 		 375 aa  298  7e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  50.48 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  47.3 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  48.24 
 
 		 368 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  44.29 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  45.14 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  45.14 
 
 		 352 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  45.43 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  45.43 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  45.09 
 
 		 390 aa  293  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  44.54 
 
 		 352 aa  291  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  48.72 
 
 		 360 aa  291  9e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  48.05 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  45.83 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  48.38 
 
 		 387 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  50.32 
 
 		 360 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  47.91 
 
 		 386 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  44.96 
 
 		 353 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  44.13 
 
 		 352 aa  289  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  43.43 
 
 		 374 aa  289  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  48.23 
 
 		 386 aa  289  6e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  43.39 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  43.43 
 
 		 380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  42.54 
 
 		 356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  46.06 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  51.96 
 
 		 355 aa  286  5e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  45.57 
 
 		 385 aa  285  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  47.4 
 
 		 386 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  44.89 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  43.91 
 
 		 361 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  46.41 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  46.43 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00810  putative DNA repair photolyase  45.01 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  44.52 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  44.55 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  42.86 
 
 		 361 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  44.92 
 
 		 343 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  45.53 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  47.6 
 
 		 437 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  47.67 
 
 		 375 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  48.16 
 
 		 374 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  47.83 
 
 		 374 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  45.45 
 
 		 376 aa  275  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  45.06 
 
 		 352 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  45.82 
 
 		 385 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  45.78 
 
 		 387 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  47.06 
 
 		 415 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  45.17 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  44.03 
 
 		 375 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  45.21 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  45.21 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  43.12 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  43.91 
 
 		 372 aa  272  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  45.33 
 
 		 385 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  45.83 
 
 		 365 aa  272  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  45.33 
 
 		 385 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  45.33 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  45.33 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2190  radical SAM domain-containing protein  46.62 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  45.76 
 
 		 359 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  43.91 
 
 		 360 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  45.7 
 
 		 417 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  43.02 
 
 		 385 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  45 
 
 		 374 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  43.02 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  41.57 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  43.51 
 
 		 392 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  43.51 
 
 		 392 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  43.67 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2212  hypothetical protein  46.58 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2633  radical SAM domain-containing protein  45.76 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.346607  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  43.33 
 
 		 391 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  43.19 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  43.19 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  43.19 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  41.95 
 
 		 366 aa  259  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5416  radical SAM domain-containing protein  43.77 
 
 		 378 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  44.92 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  42.71 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  43.27 
 
 		 362 aa  252  7e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  44.26 
 
 		 364 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  44.48 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  41.87 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  42.5 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3675  radical SAM domain-containing protein  43.79 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.852388 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  42.81 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  42.81 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  42.25 
 
 		 362 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  42.62 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>