192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1080 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  82.12 
 
 		 386 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  100 
 
 		 386 aa  791    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  89.07 
 
 		 387 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  95.6 
 
 		 393 aa  765    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  84.75 
 
 		 387 aa  682    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  92.49 
 
 		 386 aa  742    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  84.53 
 
 		 377 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  67.69 
 
 		 390 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  67.69 
 
 		 390 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  67.69 
 
 		 390 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  67.69 
 
 		 395 aa  509  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  69.21 
 
 		 384 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  67.98 
 
 		 385 aa  507  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  66.85 
 
 		 437 aa  498  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  66.38 
 
 		 385 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  68.04 
 
 		 385 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  64.69 
 
 		 385 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  59.63 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  61.45 
 
 		 387 aa  443  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  61.6 
 
 		 374 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  61.32 
 
 		 380 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  60.73 
 
 		 375 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2190  radical SAM domain-containing protein  58.45 
 
 		 373 aa  411  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  55.52 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  58.97 
 
 		 372 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  55.71 
 
 		 363 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  54.31 
 
 		 373 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  53.31 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  55.59 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  55.24 
 
 		 375 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  54.86 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  54.15 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  53.59 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  54.08 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  50.28 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  54.18 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  54.29 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  52.44 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  57.22 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  52.99 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  50.68 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3675  radical SAM domain-containing protein  54.65 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.852388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  51.99 
 
 		 374 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5416  radical SAM domain-containing protein  58.77 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  51.57 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  53.03 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  52.31 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  53.03 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  52.02 
 
 		 385 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  53.03 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  52.02 
 
 		 385 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  52.24 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  53.14 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  53.67 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  52.24 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  51.94 
 
 		 392 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  51.94 
 
 		 392 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  51.94 
 
 		 388 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  53.05 
 
 		 383 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  53.14 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  54.57 
 
 		 362 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  54.86 
 
 		 362 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  52.54 
 
 		 392 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  52.73 
 
 		 374 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  51.42 
 
 		 374 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  49.86 
 
 		 386 aa  361  9e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  52.24 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  51.44 
 
 		 415 aa  358  9e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  51.43 
 
 		 352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  50.57 
 
 		 372 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  50.43 
 
 		 352 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  51 
 
 		 352 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  51 
 
 		 352 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2212  hypothetical protein  55.79 
 
 		 325 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  47.95 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  51.27 
 
 		 366 aa  349  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  52.01 
 
 		 360 aa  348  9e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  51.99 
 
 		 378 aa  346  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  50.7 
 
 		 364 aa  345  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  53.71 
 
 		 359 aa  345  6e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00810  putative DNA repair photolyase  51.14 
 
 		 352 aa  345  7e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  53.69 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1181  radical SAM family protein  53.67 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  47.72 
 
 		 372 aa  333  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  45.63 
 
 		 385 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  45.36 
 
 		 402 aa  322  6e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  46.99 
 
 		 358 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  48.01 
 
 		 359 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  46.13 
 
 		 389 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  49.57 
 
 		 355 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  42.05 
 
 		 357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  47.4 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  42.33 
 
 		 352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  42.17 
 
 		 356 aa  282  6.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  44.7 
 
 		 357 aa  279  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  41.64 
 
 		 350 aa  275  9e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1071  Radical SAM domain protein  41.08 
 
 		 360 aa  272  9e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  38.29 
 
 		 354 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  42.69 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  42.39 
 
 		 343 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>