195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0937 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  785    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  76.1 
 
 		 385 aa  625  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  79.31 
 
 		 385 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  78.51 
 
 		 385 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  74.12 
 
 		 390 aa  588  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  73.85 
 
 		 390 aa  587  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  71.8 
 
 		 390 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  71.43 
 
 		 384 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  68.64 
 
 		 387 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  68.64 
 
 		 386 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  70.09 
 
 		 377 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  67.51 
 
 		 386 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  67.8 
 
 		 386 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  66.95 
 
 		 393 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  67.45 
 
 		 387 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  66.19 
 
 		 395 aa  480  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  66.39 
 
 		 437 aa  478  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  64.39 
 
 		 387 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  56.59 
 
 		 421 aa  441  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  61.34 
 
 		 374 aa  428  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  60.33 
 
 		 380 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  61.14 
 
 		 372 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  61.94 
 
 		 375 aa  411  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  56.1 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  56.86 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  56.29 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  57.06 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  56.45 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  56.8 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  56.45 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  57.23 
 
 		 381 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  55.03 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  56.64 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  57.52 
 
 		 361 aa  391  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  55.81 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  54.73 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  51.68 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  54.73 
 
 		 385 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  54.73 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  54.73 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  54.6 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  54.73 
 
 		 385 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  54.73 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  55.78 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  56.27 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  54.91 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  54.6 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  54.28 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  54.3 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2190  radical SAM domain-containing protein  56.11 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  54.3 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  54.96 
 
 		 375 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  56.03 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  54.3 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  54.46 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  54.29 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  54.28 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  57.95 
 
 		 390 aa  385  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  55.37 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  57.69 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5416  radical SAM domain-containing protein  60.12 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  56.66 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  52.21 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  51.85 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  53.16 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  54.31 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  55.14 
 
 		 352 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3675  radical SAM domain-containing protein  55.08 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.852388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2212  hypothetical protein  57.73 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  56 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00810  putative DNA repair photolyase  57.8 
 
 		 352 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  56 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  51.42 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  52.98 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  52.45 
 
 		 415 aa  368  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  52.87 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  54.29 
 
 		 362 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  53.17 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  52.97 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  51.7 
 
 		 378 aa  353  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1181  radical SAM family protein  56.94 
 
 		 362 aa  354  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  53.3 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  51.59 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  47.71 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  49.58 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  52.17 
 
 		 355 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  44.82 
 
 		 372 aa  310  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  43.06 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  43.06 
 
 		 402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  46.84 
 
 		 359 aa  306  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  42.27 
 
 		 352 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  45.71 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  44.86 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1071  Radical SAM domain protein  41.64 
 
 		 360 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  40.91 
 
 		 357 aa  279  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  38.87 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  38 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  43.31 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  43.31 
 
 		 343 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>