188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0047 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 		 298 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  44.49 
 
 		 298 aa  239  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  40.14 
 
 		 295 aa  237  1e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  45.15 
 
 		 295 aa  235  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0708  Radical SAM domain protein  47.71 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  41.83 
 
 		 275 aa  206  5e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  39.02 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0183  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  30.99 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  34.03 
 
 		 377 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  35.87 
 
 		 352 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  35.87 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  35.87 
 
 		 352 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 		 385 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 		 385 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 		 385 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 		 383 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 		 385 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 		 385 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  32.64 
 
 		 386 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  35.4 
 
 		 352 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  38.79 
 
 		 374 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  33.56 
 
 		 386 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  32.29 
 
 		 393 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  34.9 
 
 		 350 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  32.29 
 
 		 387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  32.64 
 
 		 387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  38.32 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  32.29 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  37.12 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  37.38 
 
 		 388 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  35.86 
 
 		 352 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  37.38 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  37.38 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  36.92 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  38.42 
 
 		 352 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  36.92 
 
 		 391 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  38.28 
 
 		 389 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  36.45 
 
 		 392 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  35.86 
 
 		 417 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  34.13 
 
 		 368 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  36.45 
 
 		 392 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  35.83 
 
 		 361 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 349 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  41.29 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  38.1 
 
 		 381 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1900  Radical SAM domain protein  32.79 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  36.22 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  33.21 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  32.25 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  36.73 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 386 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  34.62 
 
 		 353 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  37.85 
 
 		 375 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  33.6 
 
 		 362 aa  119  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  34.16 
 
 		 357 aa  119  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  34.94 
 
 		 362 aa  118  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  32.4 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  31.14 
 
 		 395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  35.98 
 
 		 374 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  31.28 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00810  putative DNA repair photolyase  31.56 
 
 		 352 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  35.85 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  30.48 
 
 		 385 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  37.14 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  33.2 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  38.62 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  36.32 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  36.73 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  35.44 
 
 		 385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  35.44 
 
 		 402 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  30.8 
 
 		 421 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  32.06 
 
 		 390 aa  112  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  35.82 
 
 		 375 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  32.78 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  32.06 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  35.05 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  33.45 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  31.36 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  33.48 
 
 		 352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  33.45 
 
 		 380 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  33.2 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  29.48 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  30.96 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 372 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  32 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  36.54 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  36.26 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  30.07 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  38.5 
 
 		 389 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  35.32 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  36.15 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  34.8 
 
 		 362 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  36.06 
 
 		 372 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  35.02 
 
 		 363 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3708  Radical SAM domain protein  31.76 
 
 		 354 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000832138  hitchhiker  0.000000507033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  37.97 
 
 		 364 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  32.67 
 
 		 373 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  35.94 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  35.27 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>