198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1011 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 301 aa  610  1e-173  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  53.79 
 
 		 301 aa  308  5e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  55.05 
 
 		 298 aa  294  1e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  54.14 
 
 		 294 aa  285  5.999999999999999e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  53.66 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  46.92 
 
 		 294 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  45.45 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  45.21 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  34.42 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  39.65 
 
 		 281 aa  142  9e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  39.91 
 
 		 366 aa  136  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  35.75 
 
 		 384 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  41.75 
 
 		 380 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  38.12 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  41.75 
 
 		 374 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  41.11 
 
 		 362 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  42.78 
 
 		 359 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  30.8 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  34.39 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  34.39 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  36.7 
 
 		 352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  44.72 
 
 		 182 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  41.57 
 
 		 375 aa  125  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  36.32 
 
 		 381 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  33.21 
 
 		 417 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  40.45 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  39.09 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  39.15 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  33.03 
 
 		 390 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  38.99 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  36.41 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  31.1 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  40.22 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  39.09 
 
 		 352 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  37.24 
 
 		 377 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  39.09 
 
 		 352 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  35.53 
 
 		 392 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  36.92 
 
 		 395 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  40.44 
 
 		 389 aa  122  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  34.35 
 
 		 391 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  37.22 
 
 		 385 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  40.38 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  35.9 
 
 		 387 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  34.35 
 
 		 392 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  34.35 
 
 		 392 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  34.35 
 
 		 388 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  36.41 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.73 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  32.24 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  34.06 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  35.75 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  34.5 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  33.91 
 
 		 392 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  34.5 
 
 		 385 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  34.1 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  34.5 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  37.99 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  35.38 
 
 		 386 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  34.5 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  34.5 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  34.5 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  31.72 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  36.74 
 
 		 358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  32.07 
 
 		 402 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  36.57 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  33.94 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  37.95 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  33.93 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  34.87 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  35.38 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  40.43 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  34.06 
 
 		 374 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  39.78 
 
 		 437 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  36.92 
 
 		 363 aa  116  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  32.42 
 
 		 362 aa  116  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  35.64 
 
 		 360 aa  116  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  32.28 
 
 		 374 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  37.33 
 
 		 372 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  37.43 
 
 		 360 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  31.32 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  35.05 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  35.15 
 
 		 352 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 349 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1181  radical SAM family protein  30.85 
 
 		 362 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  40.45 
 
 		 357 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  38.66 
 
 		 361 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  29.87 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  31.91 
 
 		 368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 		 373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  33.85 
 
 		 386 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  43.82 
 
 		 355 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  37.21 
 
 		 372 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  36.6 
 
 		 374 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  35.29 
 
 		 375 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  35.75 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>