200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0685 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  80.14 
 
 		 301 aa  486  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  76.87 
 
 		 298 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  78.08 
 
 		 297 aa  449  1e-125  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  54.14 
 
 		 301 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  46.83 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  45.02 
 
 		 294 aa  252  7e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  43.69 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  47.28 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  47.59 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  44.76 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  42.16 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  34.48 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1163  radical SAM domain-containing protein  45.24 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000309895 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  35.07 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  34.71 
 
 		 258 aa  129  9.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  37.93 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  43.17 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  42.63 
 
 		 380 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  42.63 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  42.49 
 
 		 362 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  43.93 
 
 		 375 aa  122  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  34.36 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  41.06 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  41.18 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  36.78 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  40.31 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  40.82 
 
 		 365 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  38.7 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  36.67 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  33.18 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3317  radical SAM domain-containing protein  40.1 
 
 		 355 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  39.47 
 
 		 390 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  39.06 
 
 		 368 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  35.54 
 
 		 393 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  40.1 
 
 		 352 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  37.39 
 
 		 392 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 		 392 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  41.06 
 
 		 352 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  41.06 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  39.47 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 		 388 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  33.68 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  40 
 
 		 375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  40.64 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  36.25 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  37.5 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  34.84 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  38.7 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  41.57 
 
 		 364 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  39.9 
 
 		 385 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  39.9 
 
 		 385 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  39.9 
 
 		 385 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  37.77 
 
 		 390 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  39.9 
 
 		 383 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.27 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  40.21 
 
 		 372 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  39.9 
 
 		 385 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  39.9 
 
 		 385 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  37.77 
 
 		 390 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  30.45 
 
 		 372 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  33.64 
 
 		 356 aa  115  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  40.8 
 
 		 352 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  38.92 
 
 		 357 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  39.9 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  40.37 
 
 		 437 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  39.9 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  38.38 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  38.71 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  35.25 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  36.53 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0729  radical SAM domain-containing protein  35.21 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3708  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000832138  hitchhiker  0.000000507033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  35.64 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0055  radical SAM domain-containing protein  40.11 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  39.41 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  35.51 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  40 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  38.92 
 
 		 385 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  37.95 
 
 		 385 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  37.67 
 
 		 395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  38.54 
 
 		 402 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 		 387 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 392 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  32.21 
 
 		 368 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  41.18 
 
 		 359 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  40.8 
 
 		 352 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  34.71 
 
 		 387 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  30.88 
 
 		 354 aa  112  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  36.92 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2299  radical SAM domain-containing protein  31.86 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.002919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  40.93 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  39.09 
 
 		 373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  31.27 
 
 		 370 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  30.48 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>