184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3708 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3708  Radical SAM domain protein  100 
 
 
354 aa  714    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000832138  hitchhiker  0.000000507033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3317  radical SAM domain-containing protein  60.45 
 
 
355 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.355052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0055  radical SAM domain-containing protein  60.4 
 
 
355 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1107  radical SAM domain-containing protein  49.86 
 
 
374 aa  346  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.614864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  36.45 
 
 
350 aa  122  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  35.56 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  38.16 
 
 
374 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  38.16 
 
 
380 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
383 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  34.45 
 
 
417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  35.75 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  33.51 
 
 
295 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  34.14 
 
 
385 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  32.13 
 
 
384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  34.8 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  34.8 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  35.12 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  35.32 
 
 
372 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  34.21 
 
 
390 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  34.45 
 
 
392 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  34.45 
 
 
392 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  34.29 
 
 
366 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  34.45 
 
 
388 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  37.19 
 
 
362 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  34.39 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  32.84 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  33.82 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  38.12 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  34.45 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  31.29 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  33.97 
 
 
391 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  33.01 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  33.82 
 
 
375 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  38.82 
 
 
298 aa  110  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  32.3 
 
 
421 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  32.46 
 
 
357 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0183  radical SAM domain-containing protein  33.16 
 
 
289 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  33.86 
 
 
386 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  33.01 
 
 
381 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 
295 aa  109  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  32.65 
 
 
386 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  29.35 
 
 
361 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  32.85 
 
 
363 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  33.87 
 
 
387 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  34.78 
 
 
361 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  36.13 
 
 
301 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0708  Radical SAM domain protein  34.31 
 
 
306 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  32.49 
 
 
357 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  36.46 
 
 
437 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 
352 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  38.76 
 
 
297 aa  107  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  37.7 
 
 
301 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  32.8 
 
 
393 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  35.35 
 
 
387 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 
290 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 
352 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  36.36 
 
 
352 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  33.65 
 
 
365 aa  106  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  33.82 
 
 
358 aa  106  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.76 
 
 
298 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  32.4 
 
 
386 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  25.86 
 
 
325 aa  105  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  35.92 
 
 
352 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  37.56 
 
 
362 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  37.56 
 
 
362 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  33.81 
 
 
352 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  38.2 
 
 
294 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  33.65 
 
 
375 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  32.2 
 
 
356 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  32.56 
 
 
378 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 
359 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  35.91 
 
 
352 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  35.27 
 
 
364 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  36.72 
 
 
385 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  36.95 
 
 
389 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  32.85 
 
 
368 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 
350 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  33.99 
 
 
395 aa  102  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  30.65 
 
 
275 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  33.17 
 
 
353 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00810  putative DNA repair photolyase  37.2 
 
 
352 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 
389 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2212  hypothetical protein  33.82 
 
 
325 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  33.66 
 
 
352 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  35.52 
 
 
359 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4479  DNA repair photolyase-like protein  29.52 
 
 
320 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1761  radical SAM domain-containing protein  31.8 
 
 
360 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  30.05 
 
 
298 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  33.15 
 
 
360 aa  99.8  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 
385 aa  99.8  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 
402 aa  99.8  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.246146 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>