185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0708 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0708  Radical SAM domain protein  100 
 
 
306 aa  627  1e-179  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  47.44 
 
 
295 aa  306  3e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  47.78 
 
 
295 aa  296  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  44.37 
 
 
298 aa  286  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  48.47 
 
 
298 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  38.69 
 
 
290 aa  208  9e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0183  radical SAM domain-containing protein  37.35 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 
275 aa  196  6e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 
368 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  37.93 
 
 
417 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  31.91 
 
 
386 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  32.24 
 
 
393 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  33.21 
 
 
350 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  36.94 
 
 
392 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  33.94 
 
 
370 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  36.94 
 
 
392 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  39.15 
 
 
281 aa  137  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  32.24 
 
 
386 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  36.94 
 
 
388 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  36.94 
 
 
392 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  31.58 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  38.17 
 
 
375 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  36.4 
 
 
362 aa  136  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  36.25 
 
 
392 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  33.96 
 
 
362 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  38.53 
 
 
374 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  37.95 
 
 
376 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  32.23 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  34.8 
 
 
361 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  36.04 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  38.57 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  34.47 
 
 
387 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  35.68 
 
 
374 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 
385 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 
385 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 
383 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 
385 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 
385 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3317  radical SAM domain-containing protein  35.48 
 
 
355 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.355052 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 
385 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  32.62 
 
 
349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  34.04 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  38.1 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 
374 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  38.17 
 
 
373 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  31.94 
 
 
437 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  33.81 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  37.26 
 
 
386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  32.33 
 
 
385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  33.6 
 
 
385 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1952  Radical SAM domain protein  31.91 
 
 
344 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 
421 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  31.67 
 
 
390 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  31.67 
 
 
390 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  27.31 
 
 
325 aa  126  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  39.66 
 
 
415 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  34.25 
 
 
402 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  37.24 
 
 
365 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 
390 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  36.16 
 
 
372 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  39.69 
 
 
261 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  31.35 
 
 
366 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  32.8 
 
 
373 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  32.15 
 
 
380 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 
364 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  37.56 
 
 
362 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 
359 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  38.64 
 
 
385 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  32.53 
 
 
362 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  37.89 
 
 
301 aa  123  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  32.12 
 
 
372 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  37.44 
 
 
362 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  31.83 
 
 
374 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3708  Radical SAM domain protein  34.31 
 
 
354 aa  122  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000832138  hitchhiker  0.000000507033 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  35.8 
 
 
360 aa  122  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  31.51 
 
 
375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2212  hypothetical protein  40.84 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  37.43 
 
 
362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  40.51 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  35.94 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  38.64 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0055  radical SAM domain-containing protein  34.63 
 
 
355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  37.85 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  37.22 
 
 
385 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  37.7 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  40.94 
 
 
182 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  36.2 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  36.92 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  36.04 
 
 
352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 
375 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  35.86 
 
 
352 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 
338 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  36.46 
 
 
258 aa  119  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  35.53 
 
 
276 aa  119  7e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  31.61 
 
 
360 aa  119  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  35.35 
 
 
368 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  34.29 
 
 
395 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  36.04 
 
 
352 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  27.95 
 
 
356 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>