188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3344 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 362 aa  727    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  57.18 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2004  Radical SAM domain protein  62.82 
 
 		 368 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  55.85 
 
 		 373 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  62.95 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  60 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12598  hypothetical protein  59.87 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1808  Radical SAM domain protein  62.26 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0645523  normal  0.369217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1952  Radical SAM domain protein  57.96 
 
 		 344 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  60.69 
 
 		 370 aa  361  8e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3795  radical SAM domain-containing protein  61.15 
 
 		 339 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2296  radical SAM family protein  60.88 
 
 		 341 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2343  radical SAM domain-containing protein  60.88 
 
 		 341 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2335  radical SAM domain-containing protein  60.88 
 
 		 358 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799816  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  58.88 
 
 		 350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  52.23 
 
 		 338 aa  342  5e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1745  Radical SAM domain protein  59.02 
 
 		 342 aa  342  8e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  50.78 
 
 		 349 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1220  radical SAM domain-containing protein  55.59 
 
 		 329 aa  332  4e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0539702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 389 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2697  Hedgehog/intein hint domain protein  59.51 
 
 		 715 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0729  radical SAM domain-containing protein  53.37 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4479  DNA repair photolyase-like protein  42.36 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1761  radical SAM domain-containing protein  43.93 
 
 		 360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3251  Radical SAM domain protein  48.92 
 
 		 698 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 385 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 385 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 383 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 385 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 385 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 385 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 388 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  40.82 
 
 		 392 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 392 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  33.78 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  40.07 
 
 		 392 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  39.7 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  40.07 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  39.37 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  39.33 
 
 		 391 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  38.56 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  39.69 
 
 		 352 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  28.91 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  39.69 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  33.97 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  33.21 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  38.19 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  36.76 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  39.47 
 
 		 421 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  46.35 
 
 		 362 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  46.35 
 
 		 362 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  35.42 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2479  Radical SAM domain protein  38.96 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  37.86 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  38.49 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  46.6 
 
 		 362 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  44.51 
 
 		 360 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  36.57 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  35.66 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  37.35 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  37.12 
 
 		 386 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1900  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  37.17 
 
 		 417 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  37.99 
 
 		 386 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  37.7 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  37.55 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  36.46 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  34.5 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  38.26 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  40.09 
 
 		 360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  36.95 
 
 		 352 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  36.68 
 
 		 387 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  36.95 
 
 		 352 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  37.08 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  39.68 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  36.96 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  39.2 
 
 		 359 aa  163  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 361 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  33.58 
 
 		 386 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  41.67 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  35.32 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  41.12 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  33.46 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  41.12 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  36.68 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  37.6 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  35.61 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  33.06 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  33.6 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  42.7 
 
 		 359 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  33.73 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  33.73 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  33.99 
 
 		 385 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  43.84 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  40.72 
 
 		 437 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  33.2 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  34.39 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>