181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0183 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0183  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  598  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  67.13 
 
 		 290 aa  417  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  61.68 
 
 		 275 aa  366  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  42.16 
 
 		 295 aa  224  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  42.8 
 
 		 298 aa  209  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  39.42 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0708  Radical SAM domain protein  37.7 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.82 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  32.02 
 
 		 368 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  29.88 
 
 		 362 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  30.67 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  33.76 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  31.84 
 
 		 388 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  31.84 
 
 		 392 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  31.84 
 
 		 392 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  34.08 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  30.41 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  32.92 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  30.94 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  39.31 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  31.39 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  33.18 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 		 392 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  31.53 
 
 		 392 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  29.49 
 
 		 387 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  31.98 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  33.21 
 
 		 356 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  30.26 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 		 421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  31.8 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  32.38 
 
 		 386 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  31.53 
 
 		 386 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 		 385 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 		 383 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 		 385 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 		 385 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 		 385 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 		 385 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  29.24 
 
 		 386 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  34.86 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  32.38 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  34.64 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  34.56 
 
 		 352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  34.95 
 
 		 381 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  30.22 
 
 		 384 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  29.74 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  31.43 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  27.56 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  36.42 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  33.48 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  28.08 
 
 		 387 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3708  Radical SAM domain protein  33.16 
 
 		 354 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000832138  hitchhiker  0.000000507033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  33.62 
 
 		 350 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 338 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 		 437 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  35.98 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1900  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  33.48 
 
 		 375 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  34.1 
 
 		 360 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  27.19 
 
 		 350 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2190  radical SAM domain-containing protein  35.36 
 
 		 373 aa  106  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 353 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  36.42 
 
 		 385 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 389 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  35.84 
 
 		 356 aa  105  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4479  DNA repair photolyase-like protein  28.98 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  32.72 
 
 		 352 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  36.42 
 
 		 385 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 		 352 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2479  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 		 368 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 375 aa  105  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  32.96 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  32.96 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12598  hypothetical protein  26.95 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3317  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 		 355 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1745  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  33.91 
 
 		 390 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 402 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  26.84 
 
 		 385 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  34.92 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  31.8 
 
 		 378 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 380 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  35.8 
 
 		 352 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2212  hypothetical protein  31.22 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1181  radical SAM family protein  32.97 
 
 		 362 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>