185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1745 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1745  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 342 aa  694    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  69.23 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12598  hypothetical protein  66.27 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2296  radical SAM family protein  69.25 
 
 		 341 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2343  radical SAM domain-containing protein  69.25 
 
 		 341 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2335  radical SAM domain-containing protein  69.25 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799816  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3795  radical SAM domain-containing protein  67.26 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1952  Radical SAM domain protein  59.94 
 
 		 344 aa  381  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  61.18 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  60.27 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1808  Radical SAM domain protein  61.39 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0645523  normal  0.369217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2004  Radical SAM domain protein  62.19 
 
 		 368 aa  364  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  59.02 
 
 		 362 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  56.8 
 
 		 373 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  54.33 
 
 		 357 aa  345  6e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  51.78 
 
 		 370 aa  326  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1220  radical SAM domain-containing protein  52.38 
 
 		 329 aa  322  6e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0539702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 349 aa  317  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  48.88 
 
 		 338 aa  312  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2697  Hedgehog/intein hint domain protein  62.7 
 
 		 715 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  48.09 
 
 		 389 aa  296  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0729  radical SAM domain-containing protein  49.69 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1761  radical SAM domain-containing protein  42.11 
 
 		 360 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4479  DNA repair photolyase-like protein  39.24 
 
 		 320 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3251  Radical SAM domain protein  47.06 
 
 		 698 aa  195  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  38.32 
 
 		 350 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  43.59 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  43.59 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  38.19 
 
 		 374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  48.79 
 
 		 362 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  36.9 
 
 		 381 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  38.01 
 
 		 392 aa  179  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  33.11 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  36.02 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  37.41 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  37.19 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  37.5 
 
 		 391 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  37.19 
 
 		 392 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  37.19 
 
 		 392 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  36.84 
 
 		 352 aa  175  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  37.63 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  37.07 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  37.01 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  40.18 
 
 		 363 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  35.76 
 
 		 352 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  37.79 
 
 		 352 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  38.31 
 
 		 385 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  36.3 
 
 		 362 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  38.67 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  39.75 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  41.03 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  41.03 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  38.34 
 
 		 417 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  37.3 
 
 		 386 aa  169  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 		 360 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  36.49 
 
 		 352 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  38.89 
 
 		 376 aa  169  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  37.45 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 		 421 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  39.41 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  35.44 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  35.74 
 
 		 386 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  39.41 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  38.49 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  39.41 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  38.49 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  36.69 
 
 		 385 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 		 385 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  37.94 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  32.95 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  37.22 
 
 		 362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  42.08 
 
 		 360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 353 aa  166  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  38.98 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  37.5 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  36.88 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  36.17 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  39.06 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  37.02 
 
 		 386 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  39.57 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00810  putative DNA repair photolyase  38.93 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  36.69 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  35.74 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  36.17 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  38.1 
 
 		 375 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  36.21 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  36.64 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  36.21 
 
 		 390 aa  159  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  36.21 
 
 		 390 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  39.84 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  37.5 
 
 		 415 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  36.75 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  38.17 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  36.68 
 
 		 377 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  37.45 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  36.64 
 
 		 389 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>