185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1963 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  771    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  67.72 
 
 		 349 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  60.51 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1220  radical SAM domain-containing protein  62.88 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0539702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  61.38 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0729  radical SAM domain-containing protein  58.39 
 
 		 345 aa  358  7e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  49.69 
 
 		 362 aa  332  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  52.58 
 
 		 368 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  49.38 
 
 		 357 aa  318  7.999999999999999e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  51.32 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2296  radical SAM family protein  52.53 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2343  radical SAM domain-containing protein  52.53 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2335  radical SAM domain-containing protein  52.53 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799816  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  51.75 
 
 		 350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  52.9 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12598  hypothetical protein  49.84 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3795  radical SAM domain-containing protein  50.48 
 
 		 339 aa  296  6e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2004  Radical SAM domain protein  50.79 
 
 		 368 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1808  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0645523  normal  0.369217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1952  Radical SAM domain protein  46.67 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1745  Radical SAM domain protein  48.26 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1761  radical SAM domain-containing protein  56.27 
 
 		 360 aa  285  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4479  DNA repair photolyase-like protein  49.21 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2697  Hedgehog/intein hint domain protein  52.63 
 
 		 715 aa  245  9e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3251  Radical SAM domain protein  52.97 
 
 		 698 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  37.94 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  39.15 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  44.58 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  42.05 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  43.97 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  43.97 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  43.97 
 
 		 385 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  43.97 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  43.97 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  43.97 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  44.12 
 
 		 385 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  43.19 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  43.24 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  42.75 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  43.75 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  43.58 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  42.38 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  41.61 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  41.95 
 
 		 388 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  43.53 
 
 		 374 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 		 392 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  41.95 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  41.95 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  41.2 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  43.92 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  42.39 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  42.44 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  42.69 
 
 		 417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  41.2 
 
 		 381 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  44.11 
 
 		 362 aa  189  9e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  40.07 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  42.02 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  42.31 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  40.73 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  40.42 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  41.88 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  38.95 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  40.83 
 
 		 362 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  42.34 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  39.92 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  41.67 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  42.5 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  37.54 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  38.52 
 
 		 352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  46.83 
 
 		 343 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  46.83 
 
 		 343 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  40.34 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  38.64 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  38.11 
 
 		 358 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 390 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  43.36 
 
 		 361 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  40.32 
 
 		 386 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  40.74 
 
 		 352 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  40.74 
 
 		 352 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  44.09 
 
 		 360 aa  179  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  41.55 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  41.5 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  39.92 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  38.34 
 
 		 363 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  39.11 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3675  radical SAM domain-containing protein  42.28 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.852388 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  39.11 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  36.25 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  39.61 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 380 aa  172  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  44.81 
 
 		 357 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  40.82 
 
 		 415 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  41.6 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  40.48 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  38.91 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  41.67 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  37.85 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  31.06 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  48.59 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>