188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2670 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 290 aa  595  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1900  Radical SAM domain protein  61.72 
 
 		 303 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  48 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  48.71 
 
 		 302 aa  277  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  33.21 
 
 		 362 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  32.86 
 
 		 368 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  32.13 
 
 		 338 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  30.6 
 
 		 357 aa  175  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12598  hypothetical protein  30.56 
 
 		 340 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1808  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 		 345 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0645523  normal  0.369217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 373 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3795  radical SAM domain-containing protein  30.45 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1952  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 		 344 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 370 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2296  radical SAM family protein  31.43 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2343  radical SAM domain-containing protein  31.43 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2335  radical SAM domain-containing protein  31.43 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799816  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  29.6 
 
 		 389 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2004  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 368 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  34.36 
 
 		 352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  28.93 
 
 		 350 aa  152  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  32.17 
 
 		 352 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0729  radical SAM domain-containing protein  32.42 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  34.36 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4479  DNA repair photolyase-like protein  31 
 
 		 320 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1761  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  34.23 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  32.44 
 
 		 374 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  31.03 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1745  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 		 342 aa  145  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 352 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  35.51 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  32.32 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  34.11 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  33.78 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  32.42 
 
 		 352 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  32.56 
 
 		 352 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1220  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 		 329 aa  142  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0539702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 372 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 		 376 aa  142  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  33.84 
 
 		 381 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  32.49 
 
 		 375 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  32.37 
 
 		 366 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  33.08 
 
 		 381 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  32.77 
 
 		 352 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 		 385 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 		 385 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  32.77 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  31.94 
 
 		 388 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  35.98 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  30.62 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  32.43 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  31.94 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  31.94 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  31.95 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  36.52 
 
 		 359 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  33.2 
 
 		 385 aa  135  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  30.74 
 
 		 392 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  31.56 
 
 		 392 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  33.49 
 
 		 356 aa  135  9e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  32.49 
 
 		 385 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  31.43 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  32.7 
 
 		 415 aa  133  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 374 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  29.92 
 
 		 380 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  32.51 
 
 		 387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  32.23 
 
 		 355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2697  Hedgehog/intein hint domain protein  29.58 
 
 		 715 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585756  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  31.02 
 
 		 391 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  31.69 
 
 		 386 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  30.13 
 
 		 384 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  32.08 
 
 		 385 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  32.51 
 
 		 386 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  30.08 
 
 		 378 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  29.07 
 
 		 357 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  30.77 
 
 		 386 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 		 421 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  31.69 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  31.69 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  38.37 
 
 		 359 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  33.61 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  32.66 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  33.61 
 
 		 390 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  32.88 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2212  hypothetical protein  29.29 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  34.39 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  32.43 
 
 		 354 aa  128  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  32.88 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  35.96 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  35.39 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  30.77 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  33.94 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>