185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1900 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1900  Radical SAM domain protein  100 
 
 
303 aa  622  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  61.72 
 
 
290 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  46.01 
 
 
325 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  48.74 
 
 
302 aa  276  4e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 
368 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  31.67 
 
 
373 aa  182  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  28.03 
 
 
357 aa  176  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 
338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 
362 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1952  Radical SAM domain protein  29.59 
 
 
344 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12598  hypothetical protein  30.96 
 
 
340 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  30.5 
 
 
370 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 
389 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2296  radical SAM family protein  31.95 
 
 
341 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2343  radical SAM domain-containing protein  31.95 
 
 
341 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2335  radical SAM domain-containing protein  31.95 
 
 
358 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799816  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1761  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 
360 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  28.32 
 
 
350 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  29.75 
 
 
352 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  30.11 
 
 
352 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1808  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0645523  normal  0.369217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3795  radical SAM domain-containing protein  29.54 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18338  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0729  radical SAM domain-containing protein  29.6 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  33.62 
 
 
377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  32.41 
 
 
352 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  33.19 
 
 
387 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 
352 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  32.81 
 
 
352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  31.91 
 
 
386 aa  146  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 
357 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  33.19 
 
 
386 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  31.64 
 
 
352 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2004  Radical SAM domain protein  28.67 
 
 
368 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 
385 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  32.34 
 
 
386 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 
352 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  31.91 
 
 
387 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1745  Radical SAM domain protein  28.62 
 
 
342 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1220  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 
329 aa  142  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0539702  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 
376 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  32.77 
 
 
384 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 
385 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 
385 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  33.61 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 
385 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 
385 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  31.95 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 
385 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  31.91 
 
 
393 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  32.38 
 
 
385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  31.54 
 
 
392 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  30.61 
 
 
374 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  30.04 
 
 
350 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  31.97 
 
 
392 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  31.56 
 
 
388 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 
395 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  31.69 
 
 
391 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  31.54 
 
 
392 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  31.54 
 
 
392 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 
374 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  31.03 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  32.34 
 
 
385 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  29.29 
 
 
381 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  30.24 
 
 
386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  34.6 
 
 
390 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  34.6 
 
 
390 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  32.77 
 
 
390 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 
374 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  31.05 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  28.75 
 
 
343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  31.3 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  28.75 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  28.47 
 
 
375 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  29.1 
 
 
366 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  29.06 
 
 
353 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
372 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  31.39 
 
 
361 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  35.03 
 
 
359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  25.8 
 
 
375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  30.54 
 
 
363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  28.99 
 
 
361 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  33.19 
 
 
356 aa  127  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 
385 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 
402 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  33.86 
 
 
362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  32.18 
 
 
362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 
390 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  30.96 
 
 
356 aa  126  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 
362 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4479  DNA repair photolyase-like protein  25.71 
 
 
320 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  29.28 
 
 
364 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2212  hypothetical protein  33.19 
 
 
325 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  28.97 
 
 
415 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  31.63 
 
 
350 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>