184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2599 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 338 aa  681    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3795  radical SAM domain-containing protein  87.32 
 
 		 339 aa  570  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2296  radical SAM family protein  80.77 
 
 		 341 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2343  radical SAM domain-containing protein  80.77 
 
 		 341 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2335  radical SAM domain-containing protein  80.77 
 
 		 358 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799816  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12598  hypothetical protein  76.97 
 
 		 340 aa  520  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1745  Radical SAM domain protein  68.89 
 
 		 342 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1808  Radical SAM domain protein  66.04 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0645523  normal  0.369217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  61.51 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  61.64 
 
 		 368 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2004  Radical SAM domain protein  63.49 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1952  Radical SAM domain protein  57.8 
 
 		 344 aa  363  3e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  58.6 
 
 		 350 aa  347  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  57.59 
 
 		 373 aa  347  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  54.94 
 
 		 357 aa  348  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1220  radical SAM domain-containing protein  56.12 
 
 		 329 aa  323  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0539702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  54.4 
 
 		 370 aa  322  8e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  51.11 
 
 		 338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  51.11 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  52.9 
 
 		 389 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2697  Hedgehog/intein hint domain protein  60.66 
 
 		 715 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0729  radical SAM domain-containing protein  53.74 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1761  radical SAM domain-containing protein  44.85 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3251  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 698 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  38.46 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  33.22 
 
 		 302 aa  189  8e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4479  DNA repair photolyase-like protein  37.18 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  33.89 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  39.83 
 
 		 421 aa  180  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  31.79 
 
 		 290 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  42.06 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  39.64 
 
 		 372 aa  178  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  36.36 
 
 		 356 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  42.04 
 
 		 376 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  42.08 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1900  Radical SAM domain protein  30.39 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  40.17 
 
 		 352 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  43.24 
 
 		 360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  39.74 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  38.22 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  40.71 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  41.44 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  41.44 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  41.44 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  41.44 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  40.99 
 
 		 374 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  40.99 
 
 		 391 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  41.44 
 
 		 395 aa  169  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  40.09 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  39.82 
 
 		 361 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  45.05 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  42.06 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  40.09 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  45.05 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  38.74 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  38.55 
 
 		 353 aa  166  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  39.19 
 
 		 390 aa  165  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  40.54 
 
 		 375 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  39.19 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  42.17 
 
 		 343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  38.74 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  39.38 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  36.7 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  37.97 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  40.09 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  37.99 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  40.09 
 
 		 362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  39.55 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  41.36 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  38.43 
 
 		 377 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  48.59 
 
 		 362 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  42.79 
 
 		 390 aa  162  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  39.38 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  38.43 
 
 		 386 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  36.33 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  37.99 
 
 		 387 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  39.37 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  38.89 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  40.45 
 
 		 385 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  37.55 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  37.99 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  43.18 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  37.84 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  37.84 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  38.91 
 
 		 360 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  38.2 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  36.9 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  31.62 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  40.72 
 
 		 361 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  34.58 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>