185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2530 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 275 aa  568  1e-161  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0619  hypothetical protein  66.79 
 
 		 290 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0183  radical SAM domain-containing protein  61.68 
 
 		 289 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  46.32 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  46.13 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  48.19 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.83 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0708  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  46.11 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  37.83 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  37.83 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 362 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 		 352 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  39.39 
 
 		 352 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  40.32 
 
 		 391 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  38.05 
 
 		 375 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  39.39 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  35.27 
 
 		 392 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  35.27 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  35.27 
 
 		 392 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  35.27 
 
 		 392 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  37.17 
 
 		 374 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  37.5 
 
 		 417 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  34.76 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  34.82 
 
 		 392 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  34.82 
 
 		 385 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  34.82 
 
 		 385 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  34.82 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  34.82 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  34.82 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  34.82 
 
 		 383 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  34.82 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 353 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  35.27 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  37.79 
 
 		 381 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 		 362 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  33.94 
 
 		 350 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 349 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  30.91 
 
 		 421 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  34.21 
 
 		 361 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 		 374 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  40.86 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  38.25 
 
 		 372 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  36.28 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  33.59 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  35.48 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  40.56 
 
 		 373 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 		 386 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  32.25 
 
 		 356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  32.74 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  40.34 
 
 		 389 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  36.17 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  33.33 
 
 		 325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 		 437 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  35.64 
 
 		 393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  37.78 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  36.17 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 387 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  39.18 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  39.18 
 
 		 385 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  30.64 
 
 		 368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 395 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  32.42 
 
 		 384 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  38.64 
 
 		 364 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  36.17 
 
 		 386 aa  126  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  36.63 
 
 		 362 aa  126  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  38.64 
 
 		 372 aa  125  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  35.11 
 
 		 387 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  35.63 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  38.01 
 
 		 385 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  36.67 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  35.45 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00810  putative DNA repair photolyase  39.45 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  35.45 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  35.02 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  26.42 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2212  hypothetical protein  31.63 
 
 		 325 aa  123  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  35.68 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  30.5 
 
 		 389 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  38.6 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  35.16 
 
 		 363 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  36.26 
 
 		 390 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  35.67 
 
 		 390 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  32.96 
 
 		 378 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  29.56 
 
 		 360 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  35.67 
 
 		 390 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  36.11 
 
 		 374 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  27.48 
 
 		 357 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  36.26 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  32 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0729  radical SAM domain-containing protein  33.47 
 
 		 345 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  34.56 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  29.74 
 
 		 370 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 		 281 aa  119  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  37.43 
 
 		 415 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  35.67 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>