198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1991 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
294 aa  593  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  46.3 
 
 
261 aa  216  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  48.31 
 
 
182 aa  175  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  42.67 
 
 
267 aa  150  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  43.75 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  37 
 
 
276 aa  142  7e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  35.07 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  38.01 
 
 
256 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  36.19 
 
 
245 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  37.27 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  38.12 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1721  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 
302 aa  129  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  40.18 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0830  radical SAM domain-containing protein  38.5 
 
 
242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0807  radical SAM domain-containing protein  38.5 
 
 
242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  42.71 
 
 
359 aa  125  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  40.4 
 
 
368 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1314  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 
311 aa  122  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.263305 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.21 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  33.21 
 
 
350 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1163  radical SAM domain-containing protein  39.29 
 
 
269 aa  116  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000309895 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  39.07 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  37.79 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  36.28 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  34.4 
 
 
294 aa  112  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  38.14 
 
 
381 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2299  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 
309 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.002919  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  31.87 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  34.76 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  38.03 
 
 
361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  37.82 
 
 
390 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  37.82 
 
 
390 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  34.45 
 
 
386 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  36.22 
 
 
298 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  36.5 
 
 
372 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  36.82 
 
 
363 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  32.11 
 
 
356 aa  109  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 
362 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  32.34 
 
 
370 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  39.8 
 
 
362 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  39.3 
 
 
362 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  39.06 
 
 
362 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  41.05 
 
 
375 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  37.06 
 
 
352 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  37.25 
 
 
386 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  38.24 
 
 
386 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 
349 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  30.7 
 
 
300 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  37.75 
 
 
377 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  36.76 
 
 
390 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  39.9 
 
 
417 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  36.68 
 
 
393 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  36.28 
 
 
375 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 
385 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 
385 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 
385 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  39.06 
 
 
352 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 
368 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 
383 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 
385 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  40.54 
 
 
389 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 
385 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  39.06 
 
 
352 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  36.63 
 
 
415 aa  106  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  39.06 
 
 
352 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1900  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 
303 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  37.31 
 
 
391 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  34.63 
 
 
376 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  36.04 
 
 
387 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  34.69 
 
 
384 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  34.45 
 
 
385 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 
374 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 
302 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  36.16 
 
 
385 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  32.93 
 
 
421 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  34.73 
 
 
392 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  32.91 
 
 
301 aa  102  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  35.15 
 
 
392 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  35.15 
 
 
392 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  35.15 
 
 
388 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  30.77 
 
 
350 aa  102  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  37.93 
 
 
366 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  34.73 
 
 
392 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  33.04 
 
 
362 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 
352 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  35.5 
 
 
374 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  33.33 
 
 
354 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  30.6 
 
 
373 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 
338 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  35.14 
 
 
357 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  35.03 
 
 
387 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  34.25 
 
 
338 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  38.51 
 
 
297 aa  100  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  34.05 
 
 
392 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  33.76 
 
 
372 aa  99.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  34.78 
 
 
356 aa  99.4  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  37.37 
 
 
352 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  39.89 
 
 
355 aa  99.4  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>