188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0739 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  100 
 
 
245 aa  502  1e-141  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  41.15 
 
 
261 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  37.56 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  42.46 
 
 
182 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  39.07 
 
 
258 aa  144  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  37.76 
 
 
258 aa  141  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  38.86 
 
 
269 aa  140  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  39.32 
 
 
256 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0807  radical SAM domain-containing protein  45.95 
 
 
242 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0830  radical SAM domain-containing protein  45.95 
 
 
242 aa  139  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  37.33 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  38.21 
 
 
276 aa  137  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  36.19 
 
 
294 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  38.03 
 
 
267 aa  135  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  33.87 
 
 
288 aa  128  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  37.44 
 
 
384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  33.9 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  38.82 
 
 
385 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  36.04 
 
 
368 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  35.53 
 
 
381 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  32.63 
 
 
386 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  33.05 
 
 
387 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  33.33 
 
 
387 aa  122  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  33.18 
 
 
374 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  35.53 
 
 
381 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  40 
 
 
385 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  39.41 
 
 
385 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  32.63 
 
 
386 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  35.32 
 
 
302 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  33.05 
 
 
393 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  32.72 
 
 
380 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  32.49 
 
 
386 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  33.65 
 
 
354 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 
383 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  35.35 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  34.85 
 
 
415 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  35.35 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  35.35 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  35.35 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  35.88 
 
 
375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  33.65 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  34.01 
 
 
361 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  37.06 
 
 
385 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 
374 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  33.17 
 
 
361 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  37.06 
 
 
362 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  34.34 
 
 
376 aa  115  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  37.06 
 
 
362 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
386 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  42.21 
 
 
365 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  33.04 
 
 
356 aa  115  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  36.55 
 
 
421 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  36.47 
 
 
390 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  40.38 
 
 
364 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  36.47 
 
 
390 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  35.38 
 
 
352 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  34.72 
 
 
391 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  37.65 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  33.5 
 
 
352 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  40.32 
 
 
290 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1163  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000309895 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  35.42 
 
 
300 aa  113  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  33.84 
 
 
392 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  35.43 
 
 
362 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  34.01 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  34.08 
 
 
360 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  33.84 
 
 
392 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  34.01 
 
 
352 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  37.06 
 
 
390 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  35.38 
 
 
352 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  35.17 
 
 
325 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  33.84 
 
 
374 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  38.01 
 
 
437 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  39.33 
 
 
352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  34.2 
 
 
392 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 
359 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  34.2 
 
 
392 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 
402 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  34.2 
 
 
388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  32.99 
 
 
385 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  33.5 
 
 
374 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  33.5 
 
 
417 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  34.34 
 
 
392 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  31.98 
 
 
363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1314  Radical SAM domain protein  39.13 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.263305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 
353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  30.85 
 
 
352 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 
360 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  33.84 
 
 
372 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  37.65 
 
 
362 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  34.52 
 
 
375 aa  108  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2212  hypothetical protein  41.13 
 
 
325 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  31.31 
 
 
356 aa  108  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 
395 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 
389 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  35.2 
 
 
360 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  33.85 
 
 
373 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0231722 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>