188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0807 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0807  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0830  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  42.04 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  37.97 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  44.57 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  45.95 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  39.5 
 
 		 267 aa  139  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  40.7 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  37.37 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  33.6 
 
 		 276 aa  131  9e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 281 aa  129  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2906  radical SAM family protein  31.85 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  41.38 
 
 		 352 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  36.77 
 
 		 352 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  36.41 
 
 		 350 aa  128  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  41.38 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  38.5 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  41.38 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  36.81 
 
 		 352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  40.74 
 
 		 182 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.583376 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  35.22 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  36.22 
 
 		 352 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  32.74 
 
 		 352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  37.79 
 
 		 356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  38.01 
 
 		 421 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  36.26 
 
 		 385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 		 353 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1163  radical SAM domain-containing protein  35.48 
 
 		 269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000309895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 385 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  33.5 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  36.84 
 
 		 386 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  37.24 
 
 		 389 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 385 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  35.67 
 
 		 437 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  37.78 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 360 aa  112  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 362 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  33.51 
 
 		 354 aa  112  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  38.15 
 
 		 350 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  33.69 
 
 		 385 aa  111  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 		 357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  34.76 
 
 		 362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  34.92 
 
 		 365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  32.42 
 
 		 375 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1721  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 302 aa  109  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  35.47 
 
 		 349 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  36.53 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  33.68 
 
 		 362 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  35.67 
 
 		 386 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  35.09 
 
 		 377 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  109  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  34.88 
 
 		 359 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  32.79 
 
 		 384 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  32.57 
 
 		 372 aa  108  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 		 359 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  34.5 
 
 		 360 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 		 372 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1071  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 		 360 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1314  Radical SAM domain protein  38.54 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.263305 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 		 392 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  35.67 
 
 		 393 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  34.5 
 
 		 387 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 		 392 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  31.69 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  33.92 
 
 		 415 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  32.97 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 389 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  31.22 
 
 		 385 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  32.16 
 
 		 352 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  34.09 
 
 		 361 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  31.22 
 
 		 402 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 385 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 383 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 385 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  33.53 
 
 		 368 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 385 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  32.98 
 
 		 363 aa  105  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  34.5 
 
 		 387 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  31.77 
 
 		 373 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 385 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 385 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  35.93 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  30.93 
 
 		 391 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  34.22 
 
 		 378 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  32.75 
 
 		 390 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 376 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  30.93 
 
 		 392 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 		 392 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  32.79 
 
 		 390 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  32.64 
 
 		 362 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 		 388 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4479  DNA repair photolyase-like protein  30.98 
 
 		 320 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123605  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 		 374 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 		 392 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  33.73 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>