184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2906 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2906  radical SAM family protein  100 
 
 		 306 aa  638    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  42.44 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  37.91 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0830  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0807  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 		 258 aa  127  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1856  Radical SAM domain protein  29.59 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.587316  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  35.88 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  33.5 
 
 		 354 aa  119  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  34.98 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  34.48 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  34.48 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  34.98 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  33.99 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 		 357 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  31.4 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  36.11 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  33 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  34.97 
 
 		 352 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  32.95 
 
 		 182 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  35.59 
 
 		 362 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  30.62 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  30.58 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  29.72 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  32.84 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  34.33 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 375 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  34.21 
 
 		 385 aa  99.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  29.77 
 
 		 380 aa  99  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 		 374 aa  99  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  31.68 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  31.09 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 362 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  30.15 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  33 
 
 		 355 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  31.84 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 		 437 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  31.2 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  30.39 
 
 		 384 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  29.36 
 
 		 362 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  30.52 
 
 		 357 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  30.54 
 
 		 362 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  28.51 
 
 		 360 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  34.97 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  33.68 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  35.48 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  27.83 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  29.24 
 
 		 360 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 370 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  30.88 
 
 		 385 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1071  Radical SAM domain protein  31.46 
 
 		 360 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  28.77 
 
 		 386 aa  92.8  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 375 aa  92.4  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  34.59 
 
 		 385 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  30.69 
 
 		 387 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2479  Radical SAM domain protein  30.37 
 
 		 368 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 		 390 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 		 376 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  29.61 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  28.23 
 
 		 395 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2079  radical SAM domain-containing protein  31.07 
 
 		 389 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0938828 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  32.14 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  28.51 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  30.16 
 
 		 393 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  32.2 
 
 		 245 aa  90.5  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  30.24 
 
 		 417 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  29.67 
 
 		 415 aa  90.1  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 		 361 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2292  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.699414  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 392 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 		 373 aa  89.7  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  30.69 
 
 		 377 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  29.11 
 
 		 325 aa  89.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  28.84 
 
 		 390 aa  89.7  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  27.7 
 
 		 390 aa  89.4  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  28.43 
 
 		 386 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  29.47 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  27.7 
 
 		 390 aa  89.4  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 387 aa  89  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  28.23 
 
 		 385 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  28.23 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>