86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1964 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1964  membrane protein AbrB duplication  100 
 
 		 368 aa  723    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  77.45 
 
 		 349 aa  534  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2363  Putative ammonia monooxygenase-like protein  28.41 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0952  membrane protein AbrB duplication  25.28 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0626  putative ammonia monooxygenase  29.87 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.124772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  23.84 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0543  membrane protein AbrB duplication  28.85 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4158  membrane protein AbrB duplication  24.44 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.206949  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1995  putative ammonia monooxygenase  26.67 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0189  putative ammonia monooxygenase  23.74 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.931421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1117  membrane protein AbrB duplication  24.15 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3287  membrane protein AbrB duplication  26.36 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  24.52 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1260  putative ammonia monooxygenase  26.1 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1243  putative ammonia monooxygenase  26.1 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962902  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3968  membrane protein AbrB duplication  23.77 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0495  putative ammonia monooxygenase  26.92 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2940  membrane protein AbrB duplication  25.81 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2921  membrane protein AbrB duplication  26.08 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.506523  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00664  hypothetical protein  25.81 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0763  protein AbrB  25.81 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1096  hypothetical protein  30.92 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402097  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1670  putative ammonia monooxygenase-like protein  28.85 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00675  predicted regulator  25.81 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0330  putative ammonia monooxygenase  24.71 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  22.8 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0804  protein AbrB  26.08 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0729  protein AbrB  25.81 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1230  hypothetical protein  34.62 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.180741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4903  putative ammonia monooxygenase  26.67 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.080717  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2372  membrane protein AbrB duplication  25.69 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1757  putative ammonia monooxygenase  29.75 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1723  putative ammonia monooxygenase  29.75 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0066  putative ammonia monooxygenase  25.07 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599313  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3161  putative ammonia monooxygenase  23.08 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0647069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3277  hypothetical protein  26.88 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.187445  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0629  membrane protein AbrB duplication  25.98 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0631  protein AbrB  25.27 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0238  membrane protein AbrB duplication  22.78 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3432  putative ammonia monooxygenase  23.3 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0324  putative ammonia monooxygenase  23.79 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3407  membrane protein AbrB duplication  26.03 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0189  membrane protein AbrB duplication  22.63 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.331047  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1270  putative ammonia monooxygenase  25.31 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  27.78 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5251  membrane protein AbrB duplication  28.17 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0442  putative ammonia monooxygenase  27.01 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00321  hypothetical protein  27.81 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0537644  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3334  putative ammonia monooxygenase  24.72 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.973384  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0033  hypothetical protein  27.81 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4235  hypothetical protein  24.04 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00321  hypothetical protein  27.15 
 
 		 170 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00321  hypothetical protein  26.85 
 
 		 170 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4786  membrane protein AbrB duplication  26.8 
 
 		 353 aa  53.9  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0784  membrane protein AbrB duplication  27.27 
 
 		 162 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1415  hypothetical protein  23.84 
 
 		 351 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4396  membrane protein AbrB duplication  23.9 
 
 		 343 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3212  membrane protein AbrB duplication  30.7 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4306  putative ammonia monooxygenase  23.84 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3740  membrane protein AbrB duplication  23.49 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.775905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3112  putative ammonia monooxygenase  26.56 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0549  membrane protein AbrB duplication  24.71 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0967394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1772  membrane protein AbrB duplication  46.3 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3536  membrane protein AbrB duplication  29.82 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.926126  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0853  hypothetical protein  24.07 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.502026  hitchhiker  0.00000634184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1350  putative ammonia monooxygenase  24.68 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7367  AbrB protein (AidB regulator)  29.57 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1609  putative ammonia monooxygenase  20.52 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  28.14 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0162  membrane protein AbrB duplication  25 
 
 		 352 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2810  membrane protein AbrB duplication  23.03 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49500  ammonia monooxygenase  24.92 
 
 		 364 aa  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00868936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2794  putative ammonia monooxygenase  28.66 
 
 		 377 aa  49.7  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2551  membrane protein AbrB duplication  23.86 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.944662  normal  0.50364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3969  putative ammonia monooxygenase  24.48 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.997926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1567  putative ammonia monooxygenase  21.54 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1961  putative ammonia monooxygenase  22.35 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4829  putative ammonia monooxygenase  20.8 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48350  ammonia monooxygenase  31.43 
 
 		 355 aa  46.2  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14811  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.686917  normal  0.0260683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0301  putative ammonia monooxygenase  25.35 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0363814 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0041  hypothetical protein  28.99 
 
 		 176 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3407  membrane protein AbrB duplication  29.06 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1451  hypothetical protein  27.4 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2181  membrane protein AbrB duplication  23.47 
 
 		 362 aa  43.1  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12401  hypothetical protein  28.47 
 
 		 172 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>