28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_00321 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_00321  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  319  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0033  hypothetical protein  85.29 
 
 
170 aa  276  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00321  hypothetical protein  82.35 
 
 
170 aa  271  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00321  hypothetical protein  82.94 
 
 
170 aa  271  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0537644  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0041  hypothetical protein  71.74 
 
 
176 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0036  hypothetical protein  67.13 
 
 
177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14811  hypothetical protein  54.76 
 
 
173 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.686917  normal  0.0260683 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12401  hypothetical protein  59.33 
 
 
172 aa  167  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00391  hypothetical protein  68.49 
 
 
171 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19371  hypothetical protein  57.23 
 
 
170 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1062  hypothetical protein  56.6 
 
 
170 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.836162  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0784  membrane protein AbrB duplication  33.85 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  32.11 
 
 
349 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2363  Putative ammonia monooxygenase-like protein  25.87 
 
 
383 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  32.43 
 
 
384 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4903  putative ammonia monooxygenase  32.74 
 
 
397 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.080717  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0238  membrane protein AbrB duplication  27.63 
 
 
352 aa  45.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  28.1 
 
 
338 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1964  membrane protein AbrB duplication  26.61 
 
 
368 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1757  putative ammonia monooxygenase  20.45 
 
 
357 aa  44.7  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1723  putative ammonia monooxygenase  20.45 
 
 
357 aa  44.7  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  29.85 
 
 
342 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  28.75 
 
 
342 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3407  membrane protein AbrB duplication  29.58 
 
 
358 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  27.4 
 
 
355 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0189  membrane protein AbrB duplication  28.38 
 
 
352 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.331047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4158  membrane protein AbrB duplication  27.22 
 
 
352 aa  42  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.206949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3968  membrane protein AbrB duplication  26.58 
 
 
352 aa  40.8  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>