92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2363 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  100 
 
 		 384 aa  751    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  33.05 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1230  hypothetical protein  29.18 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.180741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1723  putative ammonia monooxygenase  25.25 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1757  putative ammonia monooxygenase  25.25 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2372  membrane protein AbrB duplication  30.55 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3112  putative ammonia monooxygenase  29.39 
 
 		 362 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4158  membrane protein AbrB duplication  27.48 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.206949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3968  membrane protein AbrB duplication  27.48 
 
 		 352 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1567  putative ammonia monooxygenase  30.92 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0189  putative ammonia monooxygenase  27.91 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.931421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  28.66 
 
 		 338 aa  90.9  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2551  membrane protein AbrB duplication  29.13 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.944662  normal  0.50364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0189  membrane protein AbrB duplication  25.78 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.331047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3277  hypothetical protein  30.66 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.187445  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1995  putative ammonia monooxygenase  27.76 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0238  membrane protein AbrB duplication  25.9 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3287  membrane protein AbrB duplication  29.63 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2810  membrane protein AbrB duplication  28.27 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3334  putative ammonia monooxygenase  28.75 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.973384  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3536  membrane protein AbrB duplication  35.92 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.926126  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0549  membrane protein AbrB duplication  29.88 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0967394  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1961  putative ammonia monooxygenase  27.53 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3212  membrane protein AbrB duplication  35.92 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2181  membrane protein AbrB duplication  25.86 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  24.62 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5251  membrane protein AbrB duplication  29.92 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0629  membrane protein AbrB duplication  28.57 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2940  membrane protein AbrB duplication  26.3 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00664  hypothetical protein  26.3 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0763  protein AbrB  26.3 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00675  predicted regulator  26.3 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2794  putative ammonia monooxygenase  30.61 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2921  membrane protein AbrB duplication  26.3 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.506523  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0804  protein AbrB  26.3 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0729  protein AbrB  26.3 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1768  membrane protein AbrB duplication  29.68 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0631  protein AbrB  25.95 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0324  putative ammonia monooxygenase  28.42 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1451  hypothetical protein  27.87 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3407  membrane protein AbrB duplication  31.07 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0853  hypothetical protein  26.99 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.502026  hitchhiker  0.00000634184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4396  membrane protein AbrB duplication  26.41 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3432  putative ammonia monooxygenase  25.54 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0824  hypothetical protein  26.99 
 
 		 348 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0789  ammonia monooxygenase  27.18 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.973057  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0886  protein AbrB  26.85 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.429214 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0763  protein AbrB  26.85 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.518292  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  28.91 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0952  membrane protein AbrB duplication  22.73 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1415  hypothetical protein  25.07 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4306  putative ammonia monooxygenase  25.37 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0162  membrane protein AbrB duplication  23.84 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0727  membrane protein AbrB duplication  28.24 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1117  membrane protein AbrB duplication  27.35 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0066  putative ammonia monooxygenase  27.05 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599313  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1243  putative ammonia monooxygenase  25.16 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962902  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1260  putative ammonia monooxygenase  25.16 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4953  putative ammonia monooxygenase  26.91 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365328  normal  0.422163 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7367  AbrB protein (AidB regulator)  30.19 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  27.25 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4829  putative ammonia monooxygenase  28.38 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1964  membrane protein AbrB duplication  28.86 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3969  putative ammonia monooxygenase  24.49 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.997926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0495  putative ammonia monooxygenase  26.73 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4235  hypothetical protein  24.35 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1350  putative ammonia monooxygenase  23.6 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0637  putative ammonia monooxygenase  24.72 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015246 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48350  ammonia monooxygenase  31.73 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1609  putative ammonia monooxygenase  26.73 
 
 		 368 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0543  membrane protein AbrB duplication  26.35 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0033  hypothetical protein  32.2 
 
 		 170 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3161  putative ammonia monooxygenase  26.83 
 
 		 343 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0647069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  28.76 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2363  Putative ammonia monooxygenase-like protein  26.95 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2439  putative ammonia monooxygenase  24.91 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.246402  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00321  hypothetical protein  32.43 
 
 		 170 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00321  hypothetical protein  31.53 
 
 		 170 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0537644  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00321  hypothetical protein  31.53 
 
 		 170 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0626  putative ammonia monooxygenase  25.36 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.124772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0784  membrane protein AbrB duplication  32.03 
 
 		 162 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1270  putative ammonia monooxygenase  25.57 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14811  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.686917  normal  0.0260683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3869  putative ammonia monooxygenase  31.47 
 
 		 358 aa  46.6  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0330  putative ammonia monooxygenase  29.91 
 
 		 359 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4538  putative ammonia monooxygenase  31.21 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4769  hypothetical protein  23.91 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54580  hypothetical protein  23.62 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000205285  normal  0.0470051 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3740  membrane protein AbrB duplication  23.61 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.775905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3407  membrane protein AbrB duplication  31.18 
 
 		 358 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0301  putative ammonia monooxygenase  23.14 
 
 		 367 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0363814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1096  hypothetical protein  26.81 
 
 		 361 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402097  normal  0.189814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>