59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4903 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4903  putative ammonia monooxygenase  100 
 
 		 397 aa  784    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.080717  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1772  membrane protein AbrB duplication  53.47 
 
 		 365 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1415  hypothetical protein  26.53 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4306  putative ammonia monooxygenase  26.74 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0162  membrane protein AbrB duplication  27.6 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  25.51 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  26.06 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2181  membrane protein AbrB duplication  24.56 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4396  membrane protein AbrB duplication  26.25 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1964  membrane protein AbrB duplication  26.04 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  24.32 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1350  putative ammonia monooxygenase  26.93 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1757  putative ammonia monooxygenase  23.43 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1723  putative ammonia monooxygenase  23.43 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3968  membrane protein AbrB duplication  23.13 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  25.66 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3969  putative ammonia monooxygenase  29.31 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.997926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0952  membrane protein AbrB duplication  24.38 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4158  membrane protein AbrB duplication  23.13 
 
 		 352 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.206949  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0033  hypothetical protein  32.74 
 
 		 170 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4235  hypothetical protein  28.88 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0189  membrane protein AbrB duplication  24.91 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.331047  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00321  hypothetical protein  32.74 
 
 		 170 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3432  putative ammonia monooxygenase  25.68 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  25.07 
 
 		 355 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2372  membrane protein AbrB duplication  24.5 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3112  putative ammonia monooxygenase  23.15 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2551  membrane protein AbrB duplication  23.47 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.944662  normal  0.50364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0238  membrane protein AbrB duplication  25.87 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0442  putative ammonia monooxygenase  27.91 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00321  hypothetical protein  29.2 
 
 		 170 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0066  putative ammonia monooxygenase  25 
 
 		 355 aa  51.2  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599313  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00321  hypothetical protein  29.2 
 
 		 170 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0537644  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1230  hypothetical protein  19.59 
 
 		 355 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.180741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  22.34 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3277  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.187445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1117  membrane protein AbrB duplication  29.96 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3161  putative ammonia monooxygenase  22.12 
 
 		 343 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0647069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0629  membrane protein AbrB duplication  23.85 
 
 		 352 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1768  membrane protein AbrB duplication  23.31 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5251  membrane protein AbrB duplication  24.44 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4769  hypothetical protein  24.73 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0804  protein AbrB  36.84 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00664  hypothetical protein  36.84 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0729  protein AbrB  36.84 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2940  membrane protein AbrB duplication  36.84 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00675  predicted regulator  36.84 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0763  protein AbrB  36.84 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1567  putative ammonia monooxygenase  26.13 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1609  putative ammonia monooxygenase  29.63 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2794  putative ammonia monooxygenase  47.27 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2921  membrane protein AbrB duplication  36.84 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.506523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0189  putative ammonia monooxygenase  21.99 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.931421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2363  Putative ammonia monooxygenase-like protein  23.66 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4829  putative ammonia monooxygenase  28.7 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0631  protein AbrB  35.53 
 
 		 348 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3287  membrane protein AbrB duplication  24.29 
 
 		 361 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54580  hypothetical protein  23.67 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000205285  normal  0.0470051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0549  membrane protein AbrB duplication  29 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0967394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>