47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1772 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1772  membrane protein AbrB duplication  100 
 
 		 365 aa  703    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4903  putative ammonia monooxygenase  53.59 
 
 		 397 aa  326  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.080717  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3432  putative ammonia monooxygenase  28.01 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1230  hypothetical protein  24.48 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.180741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  29.14 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0162  membrane protein AbrB duplication  26.59 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4306  putative ammonia monooxygenase  29.1 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1350  putative ammonia monooxygenase  29.87 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1415  hypothetical protein  29.1 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4396  membrane protein AbrB duplication  28.72 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  27.01 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0952  membrane protein AbrB duplication  27.43 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0189  putative ammonia monooxygenase  26.74 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.931421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  25.5 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  25.08 
 
 		 342 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4235  hypothetical protein  29.8 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0066  putative ammonia monooxygenase  27.62 
 
 		 355 aa  53.5  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599313  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1567  putative ammonia monooxygenase  27.05 
 
 		 373 aa  53.1  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  24.68 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1454  putative ammonia monooxygenase  28.57 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2551  membrane protein AbrB duplication  24.5 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.944662  normal  0.50364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54580  hypothetical protein  28.87 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000205285  normal  0.0470051 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00321  hypothetical protein  29.63 
 
 		 170 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4769  hypothetical protein  28.17 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2372  membrane protein AbrB duplication  26.64 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3112  putative ammonia monooxygenase  25.67 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1723  putative ammonia monooxygenase  21.99 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1757  putative ammonia monooxygenase  21.99 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0330  putative ammonia monooxygenase  33.9 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3277  hypothetical protein  28.03 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.187445  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  26 
 
 		 342 aa  47.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4829  putative ammonia monooxygenase  30.77 
 
 		 374 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0033  hypothetical protein  29.73 
 
 		 170 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1964  membrane protein AbrB duplication  27.78 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2363  Putative ammonia monooxygenase-like protein  30.72 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3161  putative ammonia monooxygenase  25.22 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0647069 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  25.35 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1609  putative ammonia monooxygenase  28.57 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00321  hypothetical protein  28.83 
 
 		 170 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0537644  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00321  hypothetical protein  28.83 
 
 		 170 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7367  AbrB protein (AidB regulator)  27.1 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3969  putative ammonia monooxygenase  29.63 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.997926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3740  membrane protein AbrB duplication  32.73 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.775905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0238  membrane protein AbrB duplication  28.03 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2181  membrane protein AbrB duplication  24.37 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49500  ammonia monooxygenase  28.4 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00868936  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0495  putative ammonia monooxygenase  33.33 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>