77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4829 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4829  putative ammonia monooxygenase  100 
 
 		 374 aa  698    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1609  putative ammonia monooxygenase  85.33 
 
 		 368 aa  549  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1243  putative ammonia monooxygenase  71.73 
 
 		 383 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962902  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1260  putative ammonia monooxygenase  71.85 
 
 		 374 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1270  putative ammonia monooxygenase  72.39 
 
 		 374 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0727  membrane protein AbrB duplication  52.52 
 
 		 367 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1089  membrane protein AbrB duplication  47.38 
 
 		 375 aa  250  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2439  putative ammonia monooxygenase  49.55 
 
 		 354 aa  222  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.246402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0549  membrane protein AbrB duplication  47.02 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0967394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3161  putative ammonia monooxygenase  43.92 
 
 		 343 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0647069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3869  putative ammonia monooxygenase  50.97 
 
 		 358 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3407  membrane protein AbrB duplication  40.94 
 
 		 358 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0189  membrane protein AbrB duplication  33.92 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.331047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4158  membrane protein AbrB duplication  32.65 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.206949  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0238  membrane protein AbrB duplication  32.65 
 
 		 352 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0189  putative ammonia monooxygenase  32.19 
 
 		 352 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.931421 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3968  membrane protein AbrB duplication  31.98 
 
 		 352 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1995  putative ammonia monooxygenase  31.91 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3287  membrane protein AbrB duplication  33.9 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2181  membrane protein AbrB duplication  34.67 
 
 		 362 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00664  hypothetical protein  32.75 
 
 		 348 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0763  protein AbrB  32.75 
 
 		 348 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2940  membrane protein AbrB duplication  32.75 
 
 		 348 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00675  predicted regulator  32.75 
 
 		 348 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4538  putative ammonia monooxygenase  33.43 
 
 		 358 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0631  protein AbrB  32.46 
 
 		 348 aa  122  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2921  membrane protein AbrB duplication  33.92 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.506523  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0804  protein AbrB  33.63 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0729  protein AbrB  32.75 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0637  putative ammonia monooxygenase  32.17 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2551  membrane protein AbrB duplication  33.72 
 
 		 367 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.944662  normal  0.50364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3407  membrane protein AbrB duplication  34.41 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5251  membrane protein AbrB duplication  34 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1961  putative ammonia monooxygenase  33.62 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2810  membrane protein AbrB duplication  33.74 
 
 		 364 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0066  putative ammonia monooxygenase  33.06 
 
 		 355 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599313  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1567  putative ammonia monooxygenase  33 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3112  putative ammonia monooxygenase  30.46 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1451  hypothetical protein  30.12 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3334  putative ammonia monooxygenase  31.09 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.973384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0952  membrane protein AbrB duplication  27.16 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3536  membrane protein AbrB duplication  32.69 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.926126  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3212  membrane protein AbrB duplication  32.69 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1768  membrane protein AbrB duplication  33.22 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0886  protein AbrB  31.03 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.429214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3740  membrane protein AbrB duplication  32.09 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.775905  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0789  ammonia monooxygenase  31.38 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.973057  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0853  hypothetical protein  31.32 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.502026  hitchhiker  0.00000634184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0763  protein AbrB  31.03 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.518292  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0824  hypothetical protein  31.03 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2961  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3277  hypothetical protein  30.88 
 
 		 338 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.187445  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4953  putative ammonia monooxygenase  32.66 
 
 		 356 aa  99.4  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365328  normal  0.422163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0629  membrane protein AbrB duplication  32.76 
 
 		 352 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2372  membrane protein AbrB duplication  30.86 
 
 		 354 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7367  AbrB protein (AidB regulator)  30.37 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2794  putative ammonia monooxygenase  30.46 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48350  ammonia monooxygenase  31.82 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  28.33 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  30.09 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  25.82 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0324  putative ammonia monooxygenase  27.51 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  24.18 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  28.38 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3432  putative ammonia monooxygenase  25.48 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1757  putative ammonia monooxygenase  25 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1723  putative ammonia monooxygenase  25 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0162  membrane protein AbrB duplication  29.39 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1230  hypothetical protein  23.96 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.180741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1117  membrane protein AbrB duplication  26.2 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0442  putative ammonia monooxygenase  26.02 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  22.68 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0301  putative ammonia monooxygenase  26.4 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0363814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1415  hypothetical protein  27.2 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1454  putative ammonia monooxygenase  33.33 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4306  putative ammonia monooxygenase  28.4 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  26.73 
 
 		 343 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1772  membrane protein AbrB duplication  30.77 
 
 		 365 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.768423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>