64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1089 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1089  membrane protein AbrB duplication  100 
 
 		 375 aa  705    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0727  membrane protein AbrB duplication  54.55 
 
 		 367 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1260  putative ammonia monooxygenase  48.91 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1243  putative ammonia monooxygenase  48.91 
 
 		 383 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1270  putative ammonia monooxygenase  49.05 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4829  putative ammonia monooxygenase  47.38 
 
 		 374 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1609  putative ammonia monooxygenase  47.93 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2439  putative ammonia monooxygenase  47.46 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.246402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0549  membrane protein AbrB duplication  45.13 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0967394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3161  putative ammonia monooxygenase  40.95 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0647069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3869  putative ammonia monooxygenase  47.75 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3407  membrane protein AbrB duplication  36.89 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0189  membrane protein AbrB duplication  29.26 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.331047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4158  membrane protein AbrB duplication  29.89 
 
 		 352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.206949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3968  membrane protein AbrB duplication  29.89 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0189  putative ammonia monooxygenase  30.23 
 
 		 352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.931421 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0238  membrane protein AbrB duplication  32.2 
 
 		 352 aa  109  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0824  hypothetical protein  32.89 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0066  putative ammonia monooxygenase  35.62 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599313  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0853  hypothetical protein  32.56 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.502026  hitchhiker  0.00000634184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0763  protein AbrB  32.56 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.518292  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0886  protein AbrB  32.56 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.429214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0789  ammonia monooxygenase  32.55 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.973057  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4538  putative ammonia monooxygenase  32.76 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2181  membrane protein AbrB duplication  31.85 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3112  putative ammonia monooxygenase  30.28 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1567  putative ammonia monooxygenase  30.19 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3740  membrane protein AbrB duplication  34.73 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.775905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0804  protein AbrB  32.2 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54374  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2921  membrane protein AbrB duplication  32.2 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.506523  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00675  predicted regulator  31.53 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00664  hypothetical protein  31.53 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2940  membrane protein AbrB duplication  31.53 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0763  protein AbrB  31.53 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1995  putative ammonia monooxygenase  29.53 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0729  protein AbrB  31.86 
 
 		 348 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0952  membrane protein AbrB duplication  27.5 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0631  protein AbrB  31.19 
 
 		 348 aa  99.8  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1961  putative ammonia monooxygenase  32.4 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3287  membrane protein AbrB duplication  30.23 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3407  membrane protein AbrB duplication  33 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5251  membrane protein AbrB duplication  30.64 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3277  hypothetical protein  34.62 
 
 		 338 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.187445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3536  membrane protein AbrB duplication  32.56 
 
 		 351 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.926126  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3212  membrane protein AbrB duplication  32.56 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4953  putative ammonia monooxygenase  33.78 
 
 		 356 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365328  normal  0.422163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2551  membrane protein AbrB duplication  31.17 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.944662  normal  0.50364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2810  membrane protein AbrB duplication  31.28 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3334  putative ammonia monooxygenase  32.56 
 
 		 362 aa  86.7  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.973384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1451  hypothetical protein  31.17 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1768  membrane protein AbrB duplication  32.02 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0629  membrane protein AbrB duplication  34.5 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0637  putative ammonia monooxygenase  30 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2372  membrane protein AbrB duplication  28.03 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7367  AbrB protein (AidB regulator)  30.55 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  28.47 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  25.6 
 
 		 338 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2794  putative ammonia monooxygenase  34.93 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1230  hypothetical protein  22.54 
 
 		 355 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.180741  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48350  ammonia monooxygenase  34.82 
 
 		 355 aa  50.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  25.57 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  23.65 
 
 		 355 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  26.44 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  26.6 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>