84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0727 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0727  membrane protein AbrB duplication  100 
 
 		 367 aa  691    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1260  putative ammonia monooxygenase  52.12 
 
 		 374 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1243  putative ammonia monooxygenase  52.12 
 
 		 383 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962902  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4829  putative ammonia monooxygenase  52.52 
 
 		 374 aa  310  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1270  putative ammonia monooxygenase  51.84 
 
 		 374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1609  putative ammonia monooxygenase  49.72 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1089  membrane protein AbrB duplication  54.55 
 
 		 375 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0549  membrane protein AbrB duplication  45.13 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0967394  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2439  putative ammonia monooxygenase  47.04 
 
 		 354 aa  212  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.246402  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3161  putative ammonia monooxygenase  41.09 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0647069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3869  putative ammonia monooxygenase  50.49 
 
 		 358 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0189  membrane protein AbrB duplication  33.43 
 
 		 352 aa  156  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.331047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0238  membrane protein AbrB duplication  33.14 
 
 		 352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3407  membrane protein AbrB duplication  41.21 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0189  putative ammonia monooxygenase  34.41 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.931421 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3968  membrane protein AbrB duplication  31.96 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4158  membrane protein AbrB duplication  31.96 
 
 		 352 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.206949  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1567  putative ammonia monooxygenase  35.47 
 
 		 373 aa  133  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4538  putative ammonia monooxygenase  34.42 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0804  protein AbrB  32.45 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54374  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2921  membrane protein AbrB duplication  32.19 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.506523  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0729  protein AbrB  32.38 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  0.802179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00675  predicted regulator  31.81 
 
 		 348 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00664  hypothetical protein  31.81 
 
 		 348 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2940  membrane protein AbrB duplication  31.81 
 
 		 348 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0763  protein AbrB  31.81 
 
 		 348 aa  123  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0631  protein AbrB  31.52 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1961  putative ammonia monooxygenase  32.47 
 
 		 369 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1995  putative ammonia monooxygenase  32.37 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5251  membrane protein AbrB duplication  31.87 
 
 		 358 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0763  protein AbrB  34.37 
 
 		 348 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.518292  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0789  ammonia monooxygenase  34.37 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.973057  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0886  protein AbrB  34.37 
 
 		 348 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.429214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3334  putative ammonia monooxygenase  34.4 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.973384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0853  hypothetical protein  34.06 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.502026  hitchhiker  0.00000634184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0824  hypothetical protein  34.37 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0952  membrane protein AbrB duplication  27.79 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2810  membrane protein AbrB duplication  29.91 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0637  putative ammonia monooxygenase  31.01 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3287  membrane protein AbrB duplication  32.26 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1768  membrane protein AbrB duplication  33.67 
 
 		 366 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2181  membrane protein AbrB duplication  30.91 
 
 		 362 aa  106  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3740  membrane protein AbrB duplication  34.43 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.775905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2551  membrane protein AbrB duplication  30.9 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.944662  normal  0.50364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3112  putative ammonia monooxygenase  29.44 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1451  hypothetical protein  31.97 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3277  hypothetical protein  34.63 
 
 		 338 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.187445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0066  putative ammonia monooxygenase  31.1 
 
 		 355 aa  96.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599313  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7367  AbrB protein (AidB regulator)  31.78 
 
 		 354 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3407  membrane protein AbrB duplication  34.01 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2372  membrane protein AbrB duplication  30.94 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0629  membrane protein AbrB duplication  32.17 
 
 		 352 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4953  putative ammonia monooxygenase  28.37 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365328  normal  0.422163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3212  membrane protein AbrB duplication  34.97 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3536  membrane protein AbrB duplication  34.97 
 
 		 351 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.926126  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  27.27 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  28.17 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2794  putative ammonia monooxygenase  31.53 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0162  membrane protein AbrB duplication  27.36 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3432  putative ammonia monooxygenase  27.06 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1415  hypothetical protein  30.71 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4306  putative ammonia monooxygenase  30.83 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4396  membrane protein AbrB duplication  30.83 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  28.48 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  27.56 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0301  putative ammonia monooxygenase  30.03 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0363814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48350  ammonia monooxygenase  29.14 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0626  putative ammonia monooxygenase  26.61 
 
 		 354 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.124772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  24.62 
 
 		 342 aa  53.5  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0324  putative ammonia monooxygenase  24.5 
 
 		 343 aa  53.1  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  21.43 
 
 		 355 aa  52.8  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4235  hypothetical protein  28.52 
 
 		 344 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0543  membrane protein AbrB duplication  26.38 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1117  membrane protein AbrB duplication  28.45 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0495  putative ammonia monooxygenase  25.41 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0442  putative ammonia monooxygenase  25.86 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1723  putative ammonia monooxygenase  19.7 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1757  putative ammonia monooxygenase  19.7 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3969  putative ammonia monooxygenase  28.09 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.997926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0330  putative ammonia monooxygenase  25.41 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1350  putative ammonia monooxygenase  28.96 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00321  hypothetical protein  26.95 
 
 		 170 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00321  hypothetical protein  28.99 
 
 		 170 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00321  hypothetical protein  28.99 
 
 		 170 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0537644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>