92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3432 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3432  putative ammonia monooxygenase  100 
 
 
371 aa  723    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0442  putative ammonia monooxygenase  48.07 
 
 
375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0162  membrane protein AbrB duplication  46.75 
 
 
352 aa  273  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1117  membrane protein AbrB duplication  46.11 
 
 
364 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4786  membrane protein AbrB duplication  52.15 
 
 
353 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4306  putative ammonia monooxygenase  39.03 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4396  membrane protein AbrB duplication  40.06 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1415  hypothetical protein  39.47 
 
 
351 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  38.86 
 
 
343 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1350  putative ammonia monooxygenase  38.14 
 
 
343 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166583  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4235  hypothetical protein  40.71 
 
 
344 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3969  putative ammonia monooxygenase  40.71 
 
 
344 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.997926  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1454  putative ammonia monooxygenase  41.44 
 
 
340 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.649029  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54580  hypothetical protein  39.53 
 
 
345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000205285  normal  0.0470051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4769  hypothetical protein  39.82 
 
 
345 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49500  ammonia monooxygenase  37.46 
 
 
364 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00868936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  25.8 
 
 
355 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0189  putative ammonia monooxygenase  28.7 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.931421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2551  membrane protein AbrB duplication  29.31 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.944662  normal  0.50364 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2181  membrane protein AbrB duplication  27.12 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2810  membrane protein AbrB duplication  28.48 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659625  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0549  membrane protein AbrB duplication  32.54 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0967394  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3112  putative ammonia monooxygenase  26.52 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536468  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  26.86 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0301  putative ammonia monooxygenase  25.66 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0363814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0543  membrane protein AbrB duplication  25.07 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0629  membrane protein AbrB duplication  29.14 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0952  membrane protein AbrB duplication  27.76 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  24.93 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  23.55 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1723  putative ammonia monooxygenase  22.52 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1757  putative ammonia monooxygenase  22.52 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3161  putative ammonia monooxygenase  31.61 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0647069 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1230  hypothetical protein  21.05 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.180741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0626  putative ammonia monooxygenase  26.22 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.124772  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4158  membrane protein AbrB duplication  26.54 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.206949  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7367  AbrB protein (AidB regulator)  28.16 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0238  membrane protein AbrB duplication  25.97 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3334  putative ammonia monooxygenase  26.11 
 
 
362 aa  69.3  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.973384  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3968  membrane protein AbrB duplication  24.06 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3287  membrane protein AbrB duplication  29.02 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0330  putative ammonia monooxygenase  26.97 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328581  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0495  putative ammonia monooxygenase  25.09 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1451  hypothetical protein  26.06 
 
 
402 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1096  hypothetical protein  24.21 
 
 
361 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402097  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1768  membrane protein AbrB duplication  26.73 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3277  hypothetical protein  25.62 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.187445  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0189  membrane protein AbrB duplication  26.14 
 
 
352 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.331047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0637  putative ammonia monooxygenase  25.07 
 
 
359 aa  63.5  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015246 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0324  putative ammonia monooxygenase  24.82 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1567  putative ammonia monooxygenase  25.96 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0804  protein AbrB  25.84 
 
 
348 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54374  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0727  membrane protein AbrB duplication  26.91 
 
 
367 aa  60.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1961  putative ammonia monooxygenase  27.03 
 
 
369 aa  60.1  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4829  putative ammonia monooxygenase  25.48 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918322  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2921  membrane protein AbrB duplication  25.3 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.506523  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1609  putative ammonia monooxygenase  25.59 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1772  membrane protein AbrB duplication  26.71 
 
 
365 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  23.42 
 
 
349 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0729  protein AbrB  25.53 
 
 
348 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5251  membrane protein AbrB duplication  27.22 
 
 
358 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1995  putative ammonia monooxygenase  25.37 
 
 
362 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212349  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2940  membrane protein AbrB duplication  25.61 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1964  membrane protein AbrB duplication  24.07 
 
 
368 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0763  protein AbrB  25.61 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00664  hypothetical protein  25.61 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00675  predicted regulator  25.61 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2372  membrane protein AbrB duplication  25.24 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  26.62 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3212  membrane protein AbrB duplication  29.72 
 
 
351 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3536  membrane protein AbrB duplication  29.72 
 
 
351 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.926126  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2363  Putative ammonia monooxygenase-like protein  27.56 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3407  membrane protein AbrB duplication  28.83 
 
 
355 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0789  ammonia monooxygenase  25.08 
 
 
348 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.973057  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0824  hypothetical protein  25.48 
 
 
348 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2961  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0631  protein AbrB  25 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48350  ammonia monooxygenase  27.71 
 
 
355 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0763  protein AbrB  25.16 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.518292  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0886  protein AbrB  25.16 
 
 
348 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.429214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0853  hypothetical protein  25.48 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.502026  hitchhiker  0.00000634184 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2439  putative ammonia monooxygenase  30.83 
 
 
354 aa  50.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.246402  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0066  putative ammonia monooxygenase  25.4 
 
 
355 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599313  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0784  membrane protein AbrB duplication  31.69 
 
 
162 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4538  putative ammonia monooxygenase  26.39 
 
 
358 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3740  membrane protein AbrB duplication  26.94 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.775905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2794  putative ammonia monooxygenase  27.96 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4953  putative ammonia monooxygenase  25.08 
 
 
356 aa  46.2  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365328  normal  0.422163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1243  putative ammonia monooxygenase  23.96 
 
 
383 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4903  putative ammonia monooxygenase  25.26 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.080717  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1260  putative ammonia monooxygenase  23.96 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2134  putative ammonia monooxygenase  27.52 
 
 
339 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1270  putative ammonia monooxygenase  23.96 
 
 
374 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>