70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0162 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0162  membrane protein AbrB duplication  100 
 
 		 352 aa  671    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3432  putative ammonia monooxygenase  47.8 
 
 		 371 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0442  putative ammonia monooxygenase  42.5 
 
 		 375 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1117  membrane protein AbrB duplication  40.76 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4769  hypothetical protein  40.31 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1454  putative ammonia monooxygenase  41.34 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4786  membrane protein AbrB duplication  41.61 
 
 		 353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1415  hypothetical protein  39.43 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54580  hypothetical protein  39.59 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000205285  normal  0.0470051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4306  putative ammonia monooxygenase  39.12 
 
 		 351 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4396  membrane protein AbrB duplication  39.05 
 
 		 343 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  39.16 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1350  putative ammonia monooxygenase  36.5 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166583  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4235  hypothetical protein  36.62 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3969  putative ammonia monooxygenase  37.17 
 
 		 344 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.997926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49500  ammonia monooxygenase  38.16 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00868936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  28.53 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  29.41 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  26.73 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0952  membrane protein AbrB duplication  27.44 
 
 		 389 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0324  putative ammonia monooxygenase  27.47 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0543  membrane protein AbrB duplication  25.91 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0626  putative ammonia monooxygenase  26.44 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.124772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  23.84 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0189  membrane protein AbrB duplication  25.23 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.331047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3112  putative ammonia monooxygenase  26.38 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1723  putative ammonia monooxygenase  19.94 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1757  putative ammonia monooxygenase  19.94 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0189  putative ammonia monooxygenase  26.19 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.931421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2551  membrane protein AbrB duplication  25.76 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.944662  normal  0.50364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0330  putative ammonia monooxygenase  23.05 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0238  membrane protein AbrB duplication  27.34 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1096  hypothetical protein  28.19 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402097  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2372  membrane protein AbrB duplication  27.03 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2181  membrane protein AbrB duplication  26.91 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3277  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.187445  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1230  hypothetical protein  20.77 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.180741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2810  membrane protein AbrB duplication  25.76 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0495  putative ammonia monooxygenase  23.25 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1772  membrane protein AbrB duplication  25.66 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1567  putative ammonia monooxygenase  27.02 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0727  membrane protein AbrB duplication  28.11 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4903  putative ammonia monooxygenase  26.79 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.080717  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3161  putative ammonia monooxygenase  28.19 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0647069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4829  putative ammonia monooxygenase  29.39 
 
 		 374 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1961  putative ammonia monooxygenase  27.05 
 
 		 369 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4158  membrane protein AbrB duplication  24.78 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.206949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  30.97 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1609  putative ammonia monooxygenase  28.67 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1243  putative ammonia monooxygenase  27.97 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962902  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1260  putative ammonia monooxygenase  27.97 
 
 		 374 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3287  membrane protein AbrB duplication  33.54 
 
 		 361 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3334  putative ammonia monooxygenase  27.52 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.973384  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3968  membrane protein AbrB duplication  22.75 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1964  membrane protein AbrB duplication  25 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1995  putative ammonia monooxygenase  25.3 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0301  putative ammonia monooxygenase  27.19 
 
 		 367 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0363814 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7367  AbrB protein (AidB regulator)  28.65 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1270  putative ammonia monooxygenase  28.22 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  28.98 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0066  putative ammonia monooxygenase  25 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599313  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1768  membrane protein AbrB duplication  29.73 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1451  hypothetical protein  24.77 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0784  membrane protein AbrB duplication  36.96 
 
 		 162 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5251  membrane protein AbrB duplication  30.14 
 
 		 358 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0824  hypothetical protein  24.1 
 
 		 348 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0763  protein AbrB  24.1 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.518292  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0789  ammonia monooxygenase  24.1 
 
 		 348 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.973057  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0886  protein AbrB  24.1 
 
 		 348 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.429214 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2439  putative ammonia monooxygenase  25.86 
 
 		 354 aa  42.7  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.246402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>