92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0189 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0189  membrane protein AbrB duplication  100 
 
 		 352 aa  684    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.331047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0238  membrane protein AbrB duplication  85.51 
 
 		 352 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3968  membrane protein AbrB duplication  80.47 
 
 		 352 aa  545  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4158  membrane protein AbrB duplication  81.05 
 
 		 352 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.206949  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0189  putative ammonia monooxygenase  71.76 
 
 		 352 aa  491  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.931421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0804  protein AbrB  53.2 
 
 		 348 aa  339  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54374  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2921  membrane protein AbrB duplication  53.39 
 
 		 348 aa  339  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.506523  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00664  hypothetical protein  53.39 
 
 		 348 aa  338  7e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0763  protein AbrB  53.39 
 
 		 348 aa  338  7e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00675  predicted regulator  53.39 
 
 		 348 aa  338  7e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2940  membrane protein AbrB duplication  53.39 
 
 		 348 aa  338  7e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0729  protein AbrB  53.69 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  0.802179 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0631  protein AbrB  52.8 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0886  protein AbrB  54.69 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.429214 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0824  hypothetical protein  55 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0763  protein AbrB  54.69 
 
 		 348 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.518292  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0789  ammonia monooxygenase  54.69 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.973057  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0853  hypothetical protein  55 
 
 		 348 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.502026  hitchhiker  0.00000634184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5251  membrane protein AbrB duplication  51.61 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3287  membrane protein AbrB duplication  49.56 
 
 		 361 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3334  putative ammonia monooxygenase  48.41 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.973384  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1961  putative ammonia monooxygenase  47.4 
 
 		 369 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2181  membrane protein AbrB duplication  45.48 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1995  putative ammonia monooxygenase  45.13 
 
 		 362 aa  265  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2551  membrane protein AbrB duplication  46.95 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.944662  normal  0.50364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1567  putative ammonia monooxygenase  44.21 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1768  membrane protein AbrB duplication  47.4 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3407  membrane protein AbrB duplication  48.82 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2810  membrane protein AbrB duplication  44.71 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1451  hypothetical protein  46.44 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0629  membrane protein AbrB duplication  48.07 
 
 		 352 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3212  membrane protein AbrB duplication  47.93 
 
 		 351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3536  membrane protein AbrB duplication  47.63 
 
 		 351 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.926126  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0637  putative ammonia monooxygenase  42.12 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3112  putative ammonia monooxygenase  40.29 
 
 		 362 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0066  putative ammonia monooxygenase  45.19 
 
 		 355 aa  232  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599313  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3277  hypothetical protein  40.62 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.187445  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2372  membrane protein AbrB duplication  38.64 
 
 		 354 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2794  putative ammonia monooxygenase  41.28 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48350  ammonia monooxygenase  40.4 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1260  putative ammonia monooxygenase  34.29 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1243  putative ammonia monooxygenase  34.29 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962902  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7367  AbrB protein (AidB regulator)  34.69 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4829  putative ammonia monooxygenase  33.92 
 
 		 374 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1270  putative ammonia monooxygenase  33.24 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0727  membrane protein AbrB duplication  33.43 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1609  putative ammonia monooxygenase  33.75 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4953  putative ammonia monooxygenase  32.4 
 
 		 356 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365328  normal  0.422163 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2439  putative ammonia monooxygenase  35.22 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.246402  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3161  putative ammonia monooxygenase  36.51 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0647069 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0549  membrane protein AbrB duplication  30.21 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0967394  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1089  membrane protein AbrB duplication  29.26 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0952  membrane protein AbrB duplication  27.41 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3407  membrane protein AbrB duplication  32.95 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3869  putative ammonia monooxygenase  34 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3740  membrane protein AbrB duplication  28.85 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.775905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  25.78 
 
 		 384 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  27.16 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0442  putative ammonia monooxygenase  27.76 
 
 		 375 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1415  hypothetical protein  27.47 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4306  putative ammonia monooxygenase  28.09 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4538  putative ammonia monooxygenase  25.61 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  26.95 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4396  membrane protein AbrB duplication  27.44 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1117  membrane protein AbrB duplication  27.7 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1350  putative ammonia monooxygenase  28.42 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  25.57 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0301  putative ammonia monooxygenase  25.73 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0363814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0162  membrane protein AbrB duplication  25.53 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3432  putative ammonia monooxygenase  26.14 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0324  putative ammonia monooxygenase  24.17 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1230  hypothetical protein  20.66 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.180741  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1757  putative ammonia monooxygenase  20.38 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1723  putative ammonia monooxygenase  20.38 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  25.83 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  25.07 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0626  putative ammonia monooxygenase  23.9 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.124772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0543  membrane protein AbrB duplication  26.9 
 
 		 350 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1964  membrane protein AbrB duplication  23.12 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4903  putative ammonia monooxygenase  23.46 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.080717  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4786  membrane protein AbrB duplication  28.51 
 
 		 353 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1096  hypothetical protein  24.92 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402097  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  24.7 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54580  hypothetical protein  27.7 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000205285  normal  0.0470051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1454  putative ammonia monooxygenase  28.28 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4235  hypothetical protein  26.38 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4769  hypothetical protein  28.28 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0495  putative ammonia monooxygenase  24.92 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0330  putative ammonia monooxygenase  23.73 
 
 		 359 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0784  membrane protein AbrB duplication  26.77 
 
 		 162 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49500  ammonia monooxygenase  25.34 
 
 		 364 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00868936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3969  putative ammonia monooxygenase  25.82 
 
 		 344 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.997926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>