24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_12401 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_12401  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  316  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14811  hypothetical protein  66.86 
 
 
173 aa  220  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.686917  normal  0.0260683 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19371  hypothetical protein  64.15 
 
 
170 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1062  hypothetical protein  64.15 
 
 
170 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.836162  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00321  hypothetical protein  58.18 
 
 
170 aa  181  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0537644  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00321  hypothetical protein  58.9 
 
 
170 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0033  hypothetical protein  58.18 
 
 
170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00321  hypothetical protein  57.67 
 
 
170 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0041  hypothetical protein  60.93 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0036  hypothetical protein  58.78 
 
 
177 aa  158  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00391  hypothetical protein  61.59 
 
 
171 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2363  Putative ammonia monooxygenase-like protein  29.86 
 
 
383 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  29.53 
 
 
349 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3407  membrane protein AbrB duplication  29.34 
 
 
355 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1757  putative ammonia monooxygenase  28.24 
 
 
357 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  32.41 
 
 
384 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1723  putative ammonia monooxygenase  28.24 
 
 
357 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1567  putative ammonia monooxygenase  29.45 
 
 
373 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1964  membrane protein AbrB duplication  28.19 
 
 
368 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3212  membrane protein AbrB duplication  32.87 
 
 
351 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3536  membrane protein AbrB duplication  32.87 
 
 
351 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.926126  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0784  membrane protein AbrB duplication  29.17 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0162  membrane protein AbrB duplication  30.84 
 
 
352 aa  42  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4306  putative ammonia monooxygenase  36.9 
 
 
351 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>